METHOD FOR ENCODING HYBRIDIZATION PROBES

• Main Authors: NEWRZELLA, DIETER, FISCHER, ACHIM
• Format: Patent
• Language: English; French; German
• Published: 13.06.2002
• Edition: 7
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Identifikation von Nukleinsäuren, gekennzeichnet durch die folgenden Schritte: a) Bereitstellung mindestens eines DNA-Fragments mit einem überhängenden Ende bekannter Länge und unbekannter Sequenz; b) Befestigung eines bestimmten Encoders aus einer Mischung von Encodern mit ebenfalls überhängendem Ende an dem überhängenden Ende unbekannter Sequenz des DNA-Fragments, wobei das überhängende Ende des befestigten Encoders und das überhängende Ende unbekannter Sequenz des DNA-Fragments vollständig komplementär zueinander sind; c) gegebenenfalls Abtrennung derjenigen Encoder, welche in Schritt (b) an keinem DNA-Fragment befestigt wurden; d) Markierung des Befestigungsprodukts aus Schritt (b), sofern nicht bereits markierte Encoder zur Befestigung eingesetzt wurden; e) Hybridisierung des markierten Befestigungsprodukts mit einem Array von Oligonukleotiden, welche im wesentlichen komplementär zu einem der Stränge aller möglichen Encoder aus der Mischung von Encodern oder einer Auswahl hiervon sind. The invention relates to a method for identifying nucleic acids which is characterized by the following steps: (a) providing at least one DNA fragment with one overhang having a known length and an unknown sequence, (b) attaching a determined encoder from a mixture of encoders that also has an overhang to the DNA fragment's overhang having an unknown sequence, the overhang of the attached encoder and the DNA fragment's overhang having an unknown sequence being completely complementary to each other, (c) optionally removing those encoders that were not attached to a DNA fragment in step (b), (d) labeling the attached product from step (b) unless already labeled encoders were used for attachment, (e) hybridizing the labeled attached product to an array of oligonucleotides which are substantially complementary to one of the strands of any encoder from the mixture of encoders or from a selection thereof. Procédé d'identification d'acides nucléiques, caractérisé en ce qu'il comprend les étapes suivantes : (a) préparation d'au moins un fragment d'ADN ayant une extrémité pendante de longueur connue et de séquence inconnue, (b) fixation d'un codeur déterminé, formé d'un mélange de codeurs ayant une extrémité également pendante à l'extrémité pendante de la séquence inconnue du fragment d'ADN, l'extrémité pendante du codeur fixé et l'extrémité pendante de séquence inconnue du fragment d'ADN étant totalement complémentaires, (c) le cas échéant, séparation des codeurs qui, à l'étape (b), n'ont été fixés à aucun fragment d'ADN, (d) marquage du produit de fixation de l'étape (b), dans la mesure où des codeurs non déjà marqués pour la fixation ont été utilisés, (e) hybridation du produit de fixation marqué avec un ensemble d'oligonucléotides qui sont sensiblement complémentaires de l'un des brins de tous les codeurs possibles du mélange de codeurs ou d'une sélection de ceux-ci.