TRANSPOSITION WITH PRESERVATION OF GENE ADHESION

• Main Authors: KIA, Amirali, PANTOJA, Rigo, IOANNOU, Avgousta, GUNDERSON, Kevin L, JACKSON, Rosamond, GORYSHIN, Igor, ZHANG, Fan, JENKINS, Gareth, BETLEY, Jason Richard, GORMLEY, Niall Anthony, MORRELL, Natalie, HE, Molly, MEULEMAN, Wouter, STEEMERS, Frank J, WEIR, Jacqueline, POKHOLOK, Dmitry K, NORBERG, Steven J
• Format: Patent
• Language: English; Russian
• Published: 19.11.2020
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

FIELD: biotechnology.SUBSTANCE: invention relates to the field of biotechnology. Disclosed is a composition for producing a library. Composition contains multiple clonally indexed solid carriers, where each of solid carriers immobilises a plurality of oligonucleotides. Each of the plurality of immobilized oligonucleotides comprises a complementary sequence for capture for immobilisation on a solid carrier of a transpose complex associated with a target nucleic acid, a first sequence with a barcode and a binding site with the primer. First sequence with a barcode from each solid carrier differs from all first sequences with a barcode from other solid carriers, all of the immobilized oligonucleotides have one and the same complementary sequence for capture and all of the immobilized oligonucleotides contain the same first sequence with a barcode. Transposable complex contains a transposon bound transposon.EFFECT: invention provides obtaining information on gene adhesion, on phasing and determining the methylation status of target nucleic acid.15 cl, 21 ex, 4 tbl, 83 dwg Изобретение относится к области биотехнологии. Предложена композиция для получения библиотеки. Композиция содержит множество клонально индексированных твердых носителей, где каждый из твердых носителей иммобилизует на себе множество олигонуклеотидов. Каждый из множества иммобилизованных олигонуклеотидов содержит комплементарную последовательность для захвата для иммобилизации на твердом носителе ассоциированного c нуклеиновой кислотой-мишенью транспозомного комплекса, первую последовательность со штрих-кодом и сайт связывания с праймером. Причем первая последовательность со штрих-кодом с каждого твердого носителя отличается от всех первых последовательностей со штрих-кодом с других твердых носителей, все из иммобилизованных олигонуклеотидов содержат одну и ту же комплементарную последовательность для захвата и все из иммобилизованных олигонуклеотидов содержат одну и ту же первую последовательность со штрих-кодом. Транспозомный комплекс содержит связанный с транспозазой транспозон. Изобретение обеспечивает получение информации о сцеплении генов, о фазировании и определение статуса метилирования нуклеиновой кислоты-мишени. 14 з.п. ф-лы, 21 пр., 4 табл., 83 ил.