METHOD FOR CARRYING OUT REAL TIME PCR FOR GENOTYPING CATTLE ON ALLELES A AND B OF THE CSN3 GENE

• Main Authors: Yulmeteva Yuliana Rustemovna, Vafin Ramil Rishadovich, Tyulkin Sergej Vladimirovich, Zinnatova Farida Fatikhovna, Shakirov Shamil Kasymovich, Rzhanova Irina Vladimirovna, Muratova Aleksandra Vladimirovna
• Format: Patent
• Language: English; Russian
• Published: 01.10.2019
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

FIELD: biotechnology.SUBSTANCE: invention relates to the field of biotechnology and genetics of livestock. Method is proposed for carrying out real time PCR for genotyping cattle for alleles A and B of the CSN3 gene, in which used 5'-fluorescently-labeled direct A-allele-specific primer CSN3-A: 5'-FAM-ACTGTAGCTACTCTAGACGA-3', 5'fluorescently-labeled direct B-allele-specific primer CSN3-B: 5'-VIC-ACTGTAGCTACTCTAGATGC-3', reverse common primer CSN3-R: 5'-GCTCTCAATAACTTCTGGAGAA-3', anti-primer CSN3-S, labeled with a fluorescence quencher with 3'end of oligonucleotide: 5'-TCTAGAGTAGCTACAGT-3'-BHQ1.EFFECT: invention makes it possible to efficiently carry out the genotyping of cattle by the CSN3 gene based on real time PCR in the format of hybridization-fluorescence detection.1 cl, 2 dwg, 1 tbl Изобретение относится к области биотехнологии и генетики сельскохозяйственных животных. Предложен способ проведения ПЦР в реальном времени для генотипирования крупного рогатого скота по аллелям А и В гена CSN3, в котором используют 5'-флуоресцентно-меченый прямой А-аллель-специфический праймер CSN3-A: 5'-FAM-ACTGTAGCTACTCTAGACGA-3', 5'-флуоресцентно-меченый прямой B-аллель-специфический праймер CSN3-B: 5'-VIC-ACTGTAGCTACTCTAGATGC-3', обратный общий праймер CSN3-R: 5'-GCTCTCAATAACTTCTGGAGAA-3', анти-праймер CSN3-S, меченый гасителем флуоресценции с 3'-конца олигонуклеотида: 5'-TCTAGAGTAGCTACAGT-3'-BHQ1. Изобретение позволяет эффективно осуществить генотипирование крупного рогатого скота по гену CSN3 на основе ПЦР в реальном времени в формате гибридизационно-флуоресцентной детекции. 2 ил., 1 табл.