SYSTEM FOR THE IDENTIFICATION AND QUANTIFICATION OF HELMINTH EGGS IN ENVIRONMENTAL SAMPLES

• Main Authors: Gustavo Adolfo Rodrigo VELÁSQUEZ RODRÍGUEZ, Blanca Elena JIMÉNEZ CISNEROS, José Antonio BARRIOS PÉREZ, Catalina MAYA RENDÓN, Fernando ARÁMBULA COSÍO
• Format: Patent
• Language: English; Spanish
• Published: 27.05.2019
• Subjects: CALCULATING; COMPUTING; COUNTING; IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; PHYSICS; TESTING

Process and system for identifying and quantifying helminth eggs in water, sludge, biosolid and/or excreta samples among others, from images comprising filtering the images with an anisotropic filter maintaining the borders of the images, obtaining filtered images; filtering the filtered images applying Laplacian of Gaussian detecting changes in the filtered images, and obtaining binarized images; separating the binarized images by means of a filtered distance field Watershed filter, obtaining the images; filtering the images eliminating objects by perimeter compactness, considering the size of the objects in the images filtered again and separating the differences to avoid false positives, obtaining images with identified objects; characterizing the objects identified in the images segmenting the objects by means of gray profiles; and classifying the characterized objects according to a statistic classifier for identifying and quantifying different species of helminth eggs. Un sistema para identificar y cuantificar huevos de helmintos en muestras de agua, lodos, biosólidos y/o excretas, entre otros, a partir de imágenes, que comprende filtrar las imágenes con un filtro anisotrópico conservando los contornos en las imágenes, obteniendo imágenes filtradas; filtrar las imágenes filtradas aplicando Laplacianos de Gaussiana detectando cambios en las imágenes filtradas, y obteniendo imágenes binarizadas; separar objetos unidos en las imágenes binarizadas por medio de un filtro Watershed con campo de distancia filtrado, obteniendo imágenes; filtrar las imágenes eliminando objetos por compacidad de perímetro, considerando el tamaño de objetos en las imágenes vueltas a filtrar y separando diferencias para evitar falsos positivos, obteniendo imágenes con objetos identificados; caracterizar los objetos identificados en las imágenes segmentando los objetos mediante perfiles de gris; y clasificar los objetos caracterizados según un clasificador estadístico para identificar y cuantificar el tipo de huevo de helmintos.