마이코박테로이데스·압세수스·컴플렉스에 속하는 항산균의 erm 유전자의 1염기 변이를 판별하는 방법, 그 방법에 사용하는 프라이머 세트 및 프로브

• Main Authors: YOSHIDA MITSUNORI, MIYAMOTO SHIGEHIKO, HOSHINO YOSHIHIKO, SANO SOTARO
• Format: Patent
• Language: Korean
• Published: 16.12.2022
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

본 발명의 1 이상의 실시 형태는, 마이코박테로이데스·압세수스·컴플렉스에 속하는 항산균에 있어서, erm(41) 유전자의 1염기 변이를 판별하기 위한 새로운 수단을 제공한다. 본 발명의 1 이상의 실시 형태는, 마이코박테로이데스·압세수스·컴플렉스에 속하는 항산균에 있어서, erm(41) 유전자의 제28위에 상당하는 염기를 판정하는 방법이며, 상기 erm(41) 유전자의 상기 염기가 시토신의 경우에 게놈 DNA의 상기 erm(41) 유전자 이외의 영역에 존재하고, 티민의 경우에 존재하지 않는 지표 염기서열을, 판정 대상의 항산균의 게놈 DNA에 있어서 검출하는 것을 포함하고, 상기 지표 염기서열의 존재가, 상기 염기가 시토신인 것을 나타내고, 상기 지표 염기서열의 부존재가, 상기 염기가 티민인 것을 나타내는, 방법에 관한 것이다. According to one or more embodiments of the present invention, there is provided a new means for determining a single nucleotide mutation in erm (41) gene in a mycobacterium belonging to Mycobacteroides abscessus complex.One or more embodiments of the present invention relate to a method for determining the base corresponding to position 28 in erm (41) gene in a mycobacterium belonging to Mycobacteroides abscessus complex, comprisingdetecting, in a genomic DNA of the mycobacterium as a subject to be determined, an indicator nucleotide sequence, which is present in the region except erm (41) gene in the genomic DNA when the base in erm (41) gene is cytosine, and which is not present when the base is thymine, wherein the presence of the indicator nucleotide sequence indicates that the base is cytosine, and the absence of the indicator nucleotide sequence indicates that the base is thymine.