Identifying co-evolving sites and substituent amino acid residues

• Main Authors: DUVVURU MUNI RAJASEKHARA REDDY, KIM, TAE YONG, PAI PRIYADARSHINI PANEMANGALORE, AGARWAL GARIMA, SIVA KUMAR TADI VENKATA
• Format: Patent
• Language: English; Korean
• Published: 16.07.2021
• Subjects: INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

Disclosed is a method for identifying co-evolving sites and one or more substituent amino acid residues. The method comprises: a step of acquiring the current status of protein and the ancestor status of protein; a step of determining one or more co-evolving sites related to protein and one or more amino acid substitutions based on the current status of protein and ancestor status of protein; a step of accessing one or more amino acid substitutions as a function of nucleotide substitution in the protein; a step of accessing one or more co-evolving sites substitutions based on the one or more accessed amino acids substitutions; and a step of identifying the co-evolving sites and one or more substituent amino acid residues. The present invention aims to provide a method for identifying co-evolving sites and one or more substituent amino acid residues, which is able to evaluate substitutions based on one or more structurally and functionally important parts. 본원 구체예는 공동-진화 부위 및 하나 이상의 치환기 아미노산 잔기를 식별하는 방법을 개시한다. 상기 방법은 단백질의 현재 상태 및 단백질의 조상 상태를 수득하는 단계를 포함한다. 또한, 상기 방법은 단백질의 현재 상태 및 단백질의 조상 상태에 기초하여 단백질과 연관된 하나 이상의 공동-진화 부위와 함께 하나 이상의 아미노산 치환을 결정하는 단계를 포함한다. 또한, 상기 방법은 단백질에서 뉴클레오티드 치환의 함수로서 하나 이상의 아미노산 치환에 엑세스하는 단계를 포함한다. 또한, 상기 방법은 하나 이상의 엑세스된 아미노산 치환에 기초하여 하나 이상의 공동-진화 부위 치환에 엑세스하는 단계를 포함한다. 또한, 상기 방법은 공동-진화 부위 및 하나 이상의 치환기 아미노산 잔기를 식별하는 단계를 포함한다.