생물정보학 데이터의 인덱싱을 위한 방법 및 시스템

게놈 서열분석기에 의해 생성된 게놈 서열 데이터의 인덱싱을 위한 방법 및 장치. 제안된 방법은 서열분석기에 의해 생성된 미가공 서열 데이터 및 특정 매칭 기준에 따라 임의의 참조 서열 상에 매핑될 수 없는 서열 리드 둘 다에 적용될 수 있다. 본 발명은 브라우징 및 효율적인 선택적 액세스를 가능하게 하기 위해 비정렬된 서열 리드를 분할 및 인덱싱하는 방법을 기술한다. Method and apparatus for the indexing of genome sequence data produced by genome sequencing m...

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Main Authors ZOIA GIORGIO, ALBERTI CLAUDIO, RENZI DANIELE, BALUCH MOHAMED KHOSO
Format Patent
LanguageKorean
Published 19.06.2019
Subjects
INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
PHYSICS
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Summary:게놈 서열분석기에 의해 생성된 게놈 서열 데이터의 인덱싱을 위한 방법 및 장치. 제안된 방법은 서열분석기에 의해 생성된 미가공 서열 데이터 및 특정 매칭 기준에 따라 임의의 참조 서열 상에 매핑될 수 없는 서열 리드 둘 다에 적용될 수 있다. 본 발명은 브라우징 및 효율적인 선택적 액세스를 가능하게 하기 위해 비정렬된 서열 리드를 분할 및 인덱싱하는 방법을 기술한다. Method and apparatus for the indexing of genome sequence data produced by genome sequencing machines. The proposed method can be applied both to raw sequence data produced by sequencing machines and to those sequence reads that cannot be mapped on any reference sequence according to specific matching criteria. This invention describes a method to partition and index unaligned sequence reads to enable browsing and efficient selective access.
Bibliography:Application Number: KR20197013419