펄스 호출자 및 베이스 호출자

• Main Authors: REED BRIAN, DAVEY MEL, GYARFAS BRETT J, WENGER CRAIG, FIFE KEITH G, JIA JIMMY, ROTHBERG JONATHAN M
• Format: Patent
• Language: Korean
• Published: 13.02.2019
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES; MEASURING; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; TESTING; VINEGAR; WINE

핵산들의 서열분석 동안 센서로부터 취득된 데이터에 기초하여 뉴클레오티드들을 식별하기 위한 시스템 및 방법들. 이 방법은, 뉴클레오티드 혼입 이벤트들 동안 뉴클레오티드들과 연관된 발광 표지들로부터 검출된 광의 특성들을 획득하는 단계를 포함할 수 있다. 특성들은, 각각의 뉴클레오티드 혼입 이벤트에 대해, 광의 시간 특성 및 광의 세기 특성을 포함할 수 있다. 시간 특성은 여기 이후의 발광 표지에 의한 광자 방출 확률의 감쇠 속도를 나타낸다. 이 방법은, 뉴클레오티드 혼입 이벤트들의 특성들을 나타내는 포인트들을 포인트들의 그룹들로 그룹화하는 단계를 더 포함할 수 있다. 개별 포인트들은 대응하는 뉴클레오티드 혼입 이벤트에 대한 적어도 시간 특성 및 세기 특성을 나타낼 수 있다. 이 방법은, 개별 뉴클레오티드들에 포인트들의 그룹들을 할당하는 단계를 더 포함할 수 있다. System and methods for identifying nucleotides based on data acquired from a sensor during sequencing of nucleic acids. The method may include obtaining characteristics of light detected from luminescent labels associated with the nucleotides during nucleotide incorporation events. The characteristics may include, for each nucleotide incorporation event, a temporal characteristic the light and an intensity characteristic of the light. The temporal characteristic representing a speed of decay of a probability of photon emission by a luminescent label after excitation. The method may further include grouping points representing the characteristics of the nucleotide incorporation events into groups of points. The individual points may represent at least the temporal characteristic and the intensity characteristic for a corresponding nucleotide incorporation event. The method may further include assigning the groups of points to individual nucleotides.