SYSTEMS APPARATUS AND METHODS FOR GENERATING AND ANALYZING RESISTOME PROFILES

• Main Authors: SAEED ALEX, JONES EVAN, WALKER GEORGE TERRANCE, SAPIRO VADIM
• Format: Patent
• Language: English; Korean
• Published: 06.03.2017
• Subjects: CALCULATING; COMPUTING; COUNTING; ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING; HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATIONTECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING ORPROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

예를 들어, 제1 샘플로부터의 유기체의 1 이상의 항생제 내성 척도를 나타내는 제1 데이터를 취득하고, 유기체를 확인하고, 항생제 감수성 표현형, 항생제 내성 유전자의 아이덴티티, 및 유기체가 비감수성을 보이는 항생제 중 적어도 하나를 결정하고, 제1 패턴을 생성하고, 이를 1 이상의 알려진 패턴과 비교하여 제1 패턴과 1 이상의 알려진 패턴 사이의 역치를 초과하는 유사도를 나타내는 프로파일 유일성 식별자를 결정하고, 생성함으로써, 피험체에 대한 레지스톰 프로파일을 생성하기 위한, 하나 이상의 피험체의 감염 상태를 모니터링하기 위한, 및/또는 시설에서의 잠재적인 감염 집단발생을 확인하기 위한 시스템, 장치, 및 방법을 개시한다. Systems, apparatus, and methods are disclosed for generating a resistome profile for a subject, monitoring an infection state of one or more subjects, and/or identifying a potential infection outbreak at a facility, for example, by obtaining first data representative of at least one measure of antibiotic resistance of an organism from a first sample, identifying the organism, determining at least one of an antibiotic susceptibility phenotype, an identity of an antibiotic resistance gene, and an antibiotic to which the organism is non-susceptible, generating and comparing a first pattern to at least one known pattern to determine and generate a profile uniqueness identifier indicating a degree of similarity above a threshold between the first pattern and the at least one known pattern.