Partial gyrA gene sequences and an identification method of Bacillus subtilis and related taxa using the said sequences

• Main Authors: OH, HYEON U, CHUN, JONG SIK, BAE, GYEONG SUK, KIM, YEONG GUK
• Format: Patent
• Language: English; Korean
• Published: 29.01.2002
• Edition: 7
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS THEREOF; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

PURPOSE: The nucleotide sequence of DNA gyrase subunit A(gyrA) genes and a method for identifying Bacillus subtilis and its related taxa using the same are provided, thereby correctly identifying the Bacillus subtilis up to the sub-species level. CONSTITUTION: The DNA gyrase subunit A(gyrA) genes of Bacillus amyloliquefaciens (KCTC 1660T), Bacillus atrophaeus (KCTC 3701T), Bacillus licheniformis (KCTC 1918T), Bacillus mojavensis (NRRL B-14698T), Bacillus subtilis subsp. subtilis (KCTC 3135T), Bacillus subtilis subsp. spizizenii (NRRL B-23049T) and Bacillus vallismortis (NRRL B-14890T) have the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8 and SEQ ID NO: 9, respectively. The Bacillus subtilis and its related taxa are identified by using DNA gyrase subunit A(gyrA) genes mentioned above. 본 발명은 DNA 자이레이즈 서브유닛 A(DNA gyrase subunit A,A) 유전자 절편의 염기서열 및 이를 이용한 바실러스 서브틸리스() 및 관련 종의 동정방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 바실러스 서브틸리스 종의 DNA 자이레이즈 서브유닛 A 유전자 절편의 염기서열을 결정하고 그 계통수를 분석함으로써 대표적 유용 미생물인 바실러스 서브틸리스 및 관련 종을 동정하는 방법에 관한 것이다. 본 발명의 동정 방법을 이용하면 기존의 16S rRNA 유전자 분석법으로 동정이 불가능했던 바실러스 서브틸리스 관련 종을 아종 단계까지 정확하게 동정할 수 있으며, 본 발명의 DNA 자이레이즈 서브유닛 A 유전자의 염기서열은 DNA 탐침(probe) 또는 DNA 칩(chip) 등에 응용되어 바실러스 서브틸리스 관련 종을 탐색하는데 유용하게 이용될 수 있다.