DNA SEQUENCING USING HYDROGEL BEAD

• Main Authors: ERICH B JAEGER, FILIZ PE-YASAR, MOSTAFA RONAGHI, WU YIR-SHYUAN, VICTORIA POPIC, TARUN KUMAR KHURANA
• Format: Patent
• Language: English; Japanese
• Published: 12.03.2024
• Subjects: APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; ENZYMOLOGY; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; SPIRITS; VINEGAR; WINE

To provide a system, a method and a composition for preparing beads that encapsulate long DNA fragments for creating a spatial index having high throughput.SOLUTION: A method and a system of the present invention include: encapsulating a sample of DNA fragments into hydrogel beads; loading hydrogel beads that encapsulate the sample of DNA fragments on a flow cell device; fabricating a library; releasing the fabricated library on a surface of the flow cell device; and clustering and sequencing a released library.SELECTED DRAWING: Figure 2 【課題】ハイスループットの空間インデックス作成のための長いＤＮＡ断片を封入しているビーズを調製するためのシステム、方法および組成物を提供すること。【解決手段】ある態様において、本発明の方法およびシステムは、ヒドロゲルビーズ内にＤＮＡ断片のサンプルを封入すること、ＤＮＡ断片のサンプルを封入しているヒドロゲルビーズをフローセル装置上にローディングすること、ライブラリーを作製すること、作製したライブラリーをフローセル装置の表面上にリリースすること、およびリリースされたライブラリーをクラスター化および配列決定することを含む。【選択図】図２