MULTIPLEXED ANALYSIS OF NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION THERMODYNAMICS USING INTEGRATED ARRAYS

• Main Authors: KSHAMA JIRAGE, ARUN MANICKAM, ARJANG HASSIBI, KAVEH MILANINIA
• Format: Patent
• Language: English; Japanese
• Published: 11.03.2021
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

To provide multiplexed analyses of nucleic acid hybridization thermodynamics using integrated arrays.SOLUTION: The present disclosure provides methods and devices for simultaneous identification of a plurality of target nucleic acid sequences in a single sample chamber that includes an addressable array of nucleic acid probes attached to a solid surface. Addressable signals can be generated and measured, in real time, upon hybridization of target sequences at the individual probe locations within the array while the temperature of the system is varied. Such generated signals, as a function of temperature, can then be used to compute the properties of nucleic acid hybridization at each addressable location which is ultimately utilized to estimate the sequence of the target nucleic acids. In particular, an integrated semiconductor biosensor array device can be used to measure the addressable signals.SELECTED DRAWING: None 【課題】 集積型アレイを使用する核酸ハイブリダイゼーション熱力学の多重分析の提供。【解決手段】 本開示は、固体表面へと付着させた、核酸プローブのアドレス可能なアレイを含む、単一の試料チャンバー内で、複数の標的核酸配列を同時に識別するための方法およびデバイスを提供する。システムの温度を変動させながら、アレイ内の個々のプローブ位置における、標的配列のハイブリダイゼーションの際に、リアルタイムで、アドレス可能なシグナルを、発生させ、測定することができる。次いで、このようにして発生させたシグナルであって、温度の関数としてのシグナルを使用して、各アドレス可能な位置における、核酸ハイブリダイゼーションの特性を算出することができ、最終的に、これを利用して、標的核酸の配列を推定する。特に、集積型半導体バイオセンサーアレイデバイスを使用して、アドレス可能なシグナルを測定することができる。【選択図】なし