METHOD FOR ANALYZING HIGH-THROUGHPUT SEQUENCING REACTION DATA

• Main Authors: UNNO HIROTAKA, YONEKAWA YUKI, MATSUDAIRA TAKAHIRO, KAWASHIMA YUDAI, HASHIMOTO MICHIE, YUMOTO MASAYUKI, NISHIYAMA ERI, OSAKI YUSUKE, NAKAZAWA SATOSHI
• Format: Patent
• Language: English; Japanese
• Published: 20.08.2020
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

To provide methods for analyzing high-throughput sequencing reaction data that allows the output data to be split on the basis of a threshold defined on the basis of a clear standard.SOLUTION: Provided is a method for analyzing high-throughput sequencing reaction data using one or more standard samples containing a specific copy number of nucleic acids, comprising: a) performing a library preparation under the same conditions for the standard samples and the sequence samples, b) subjecting the prepared library to a sequencing reaction to obtain output data including reads derived from the standard samples and sequence samples; and c) dividing the reads in the output data into reads below the threshold and reads above the threshold, on the basis of the threshold determined on the basis of the number of reads derived from the standard samples in the output data.SELECTED DRAWING: Figure 1 【課題】明確な基準に基づいて定められた閾値に基づいて出力データを分割することが可能な、ハイスループットシーケンス反応のデータを解析する方法の提供。【解決手段】特定コピー数の核酸を含む一以上の標準試料を用いてハイスループットシーケンス反応のデータを解析する方法であって、ａ）標準試料及びシーケンス試料に対し同一の条件においてライブラリー調製を行うステップ、ｂ）調製されたライブラリーをシーケンス反応に供し、標準試料及びシーケンス試料に由来するリードを含む出力データを得るステップ、及びｃ）出力データ中の標準試料に由来するリード数を基準に定められる閾値に基づいて、出力データ中のリードを閾値以下のリードと閾値以上のリードに分割するステップ、を含む。【選択図】図１