METHODS AND MEANS FOR DIAGNOSING LUNG CANCER

• Main Authors: MARWITZ, Sebastian, SCHEUFELE, Swetlana, GOLDMANN, Torsten, AMMERPOHL, Ole, RECK, Martin
• Format: Patent
• Language: English; French; German
• Published: 10.03.2021
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; ENZYMOLOGY; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

Die vorliegende Erfindung betrifft die Diagnose von Lungentumoren. Sie stellt Verfahren zur Verfügung, die besonders zur Diagnose von Lungentumoren auf Basis einer Flüssigbiopsie (Liquid Biopsy) geeignet sind, bei denen zellfreie DNA (zfDNA) eingesetzt wird. Dabei werden sowohl besonders geeignete Analyseverfahren als auch besonders geeignete Sätze an Methylierungsmarkern beschrieben. Gegenstand der Erfindung sind auch Mittel, geeignet zur Diagnose von Lungenkrebs durch Untersuchung der Methylierung eines Satzes von Methylierungsmarkern, bevorzugt in zfDNA aus einer Flüssigbiopsie-Probe eines Patienten, wobei das Mittel Oligonukleotide umfasst, welche mit DNA hybridisieren können, welche die Methylierungsmarker umfasst, sowie die Verwendung dieser Verfahren und Mittel zur Diagnose von Lungentumoren. The present invention relates to the diagnosis of lung tumors. It provides methods suitable both for diagnosing lung tumors on the basis of surgical samples and lung biopsies (here, e.g., with the aid of DNA microarrays) and of liquid biopsies. In the case of liquid biopsies, cell-free DNA (cfDNA) is used. In this context, both particularly suitable analysis methods and particularly suitable sets of methylation markers are described. Means suitable for diagnosing lung cancer by examinining the methylation of a set of methylation markers, e.g., in cell-free DNA (cfDNA) from liquid biopsy samples of patients, wherein the means comprises oligonucleotides which can hybridize to DNA comprising the methylation markers, as well as the use of said methods and means for diagnosing, i.e., e.g., determinination, subtyping and prognostic characterization of lung tumors are also an object of the invention.