Verfahren und Vorrichtung zur Positionsrekonstruktion von Zellen in einem dreidimensionalen Gewebe

Die Erfindung betrifft ein Verfahren zum Ermitteln einer Zuordnungsvorschrift, um Genexpressionsprofile, welche sich sehr ähnlich sind, zusammenzuführen. Das Verfahren umfasst folgende Schritte: (S23) Anpassung eines Modells, z. B. eines linearen Regressionsmodells, Verwendung des Modells zur Vorher...

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Main Authors Juerges, Christopher, Shakirov, Damir
Format Patent
LanguageGerman
Published 23.05.2024
Subjects
INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
PHYSICS
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Summary:Die Erfindung betrifft ein Verfahren zum Ermitteln einer Zuordnungsvorschrift, um Genexpressionsprofile, welche sich sehr ähnlich sind, zusammenzuführen. Das Verfahren umfasst folgende Schritte: (S23) Anpassung eines Modells, z. B. eines linearen Regressionsmodells, Verwendung des Modells zur Vorhersage der Genexpressionsprofile, (S24) Berechnung einer Kostenmatrix anhand der Vorhersagen, (S25) Anwendung des Ungarischen Algorithmus auf die Kostenmatrix, um eine neue Zuordnungsvorschrift zu erhalten und mehrfaches Wiederholen dieser Schritte. A method for determining an assignment rule in order to merge gene expression profiles which are very similar is disclosed. The method includes (i) adjusting a model, e.g. a linear regression model, using the model to predict the gene expression profiles, (ii) calculating a cost matrix from the predictions, and (iii) applying the Hungarian algorithm to the cost matrix to obtain a new assignment rule and repeating these steps several times.
Bibliography:Application Number: DE202210212416