A METHOD AND SYSTEM DETECTING A HEALTH ABNORMALITY IN A LIQUID BIOPSY SAMPLE

• Main Authors: LIU, JIAN RUI, HALNER, ANDREAS
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 23.03.2023
• Subjects: CALCULATING; COMPUTER SYSTEMS BASED ON SPECIFIC COMPUTATIONAL MODELS; COMPUTING; COUNTING; HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATIONTECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING ORPROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; PHYSICS

The present disclosure relates to a computer implemented method for detecting a health abnormality in test data derived from a liquid biopsy. In obtaining the computer implemented method, special preparation and pre-processing of training and validation data for selecting relevant features and developing and selecting a well-performing final machine learning classifier to use for the final task of predicting the presence versus absence of a health abnormality. Finally, test data, which is obtained in-part from liquid biopsy samples, are input into the chosen machine learning classifier(s) and a screening or diagnostic test result of whether an associated patient has the health abnormality in question is provided. La présente divulgation se rapporte à un procédé mis en uvre par ordinateur pour détecter une anomalie de santé dans des données de test dérivées d'une biopsie liquide. La présente invention concerne également un procédé mis en uvre par ordinateur, une préparation spéciale et un pré-traitement de données de formation et de validation pour sélectionner des caractéristiques pertinentes et développer et sélectionner un classificateur d'apprentissage automatique final à bonne performance à utiliser pour la tâche finale de prédiction de la présence ou de l'absence d'une anomalie de santé. Enfin, des données de test, qui sont obtenues en partie à partir d'échantillons de biopsie liquide, sont entrées dans le(s) classificateur(s) d'apprentissage automatique fini(s) et un résultat de test de dépistage ou de diagnostic indiquant si un patient associé à l'anomalie de santé en question, sont fournies.