METHODS, SYSTEMS, AND COMPOSITIONS FOR THE ANALYSIS OF CELL-FREE NUCLEIC ACIDS

• Main Authors: JENSEN, TAYLOR, HOLDEN, KIMBERLY
• Format: Patent
• Language: English; French
• Published: 18.11.2021
• Subjects: BEER; BIOCHEMISTRY; CHEMISTRY; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; COMPOSITIONS THEREOF; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES; CULTURE MEDIA; ENZYMOLOGY; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS; METALLURGY; MICROBIOLOGY; MICROORGANISMS OR ENZYMES; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; PHYSICS; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS; SPIRITS; VINEGAR; WINE

The present disclosure relates to methods for enriching circulating tumor DNA (ctDNA) to enhance early disease detection or predictions of disease progression. The present disclosure also relates to methods for enriching circulating fetal cell free DNA (fetal cfDNA) to enhance early disease detection. In some embodiments, the method comprises enriching ctDNA or fetal cfDNA in a sample by selecting for cell-free nucleic acid fragments that are less than 150 bp prior to copy number alteration (CNA) analysis. Also disclosed are compositions, systems, and computer-program products for analyzing circulating cell free nucleic acids by any of the methods disclosed herein. La présente divulgation concerne des procédés d'enrichissement d'ADN tumoral circulant (ADNct) pour améliorer la détection précoce de maladies ou des prédictions de la progression d'une maladie. La présente divulgation concerne également des procédés d'enrichissement d'ADN acellulaire ftal circulant (ADNcf ftal) pour améliorer la détection précoce de maladies. Dans certains modes de réalisation, le procédé comprend l'enrichissement d'ADNct ou d'ADNcf ftal dans un échantillon par sélection de fragments d'acide nucléique acellulaires qui sont inférieurs à 150 bp avant l'analyse d'altération du nombre de copies (CNA, de l'anglais « copy number alteration » ). Des compositions, des systèmes et des produits programmes d'ordinateur pour analyser des acides nucléiques acellulaires circulants par l'un quelconque des procédés de la présente invention sont également divulgués.