Agrupamento de acessos e cultivares de três espécies de Brachiaria por RAPD = RAPD grouping of accesses and cultivars of three Brachiaria species

• Published in: Acta scientiarum. Agronomy Vol. 30; no. 4; pp. 457 - 464
• Main Authors: Nelson Barbosa Machado Neto, Talita Marques Vanderlei, Luciana Machado Guaberto, Ana Claudia Ambiel
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: Eduem (Editora da Universidade Estadual de Maringá) 01.10.2008
• Subjects: Brachiaria; dendrogram; dendrograma; genetic fixation index; genetic variability; marcadores moleculares; molecular markers; variabilidade genética; índice de fixação gênica
• ISSN: 1679-9275; 1807-8621

O propósito deste trabalho foi determinar a similaridade genética entre acessos de germoplasma e cultivares comerciais de três espécies de Brachiaria (inter e intraespecífica), por meio de marcadores RAPD. Sementes foram utilizadas como fonte de DNA. 10 “primers” decâmeros foram selecionados de 120 “primers” avaliados, produzindo 107 bandas polimórficas, as quais foram utilizadas para a análise de variância molecular (Amova), o coeficiente de similaridade de Jaccard e índices de fixação gênica. 24,40% da variabilidade genética total estão contidas entre as espécies e 75,60% dentro destas, com índice de fixação gênica (FST) 0,24. No dendrograma, houve a formação de dois ramos, um formado por P. maximum e B. arrecta e o outro subdividido em três: todas amostras de B. ruziziensis; todos os acessos de B. decumbens e três acessos de B. brizantha e o último com dois acessos de B. brizantha mais as B. brizantha comerciais e a B. decumbens cv ‘Basilisk’. Foi possível agrupar os acessos e as cultivares de Brachiaria por meio de RAPD. O índice de variabilidade genética entre espécies foi considerado baixo, sendo inferior a valores determinados em algumas espécies autógamas. B. brizantha apresenta maior variabilidade genética e menor FST indicando maior fluxo gênico intra-específico do que as outras.The aim of this work was to determine intra and intergenetic similarity among three Brachiaria species for germplasm accesses and commercial cultivars using RAPD markers. Seeds were used as DNA source. 10 decamer ‘primers’ were selected among 120 ‘primers’, and 107 polymorphic bands were used to perform the analysis of molecular variance (Amova), Jaccard similarity coefficient and species fixation index. 24.4% of the total variability was contained between species and 75.6% within species, with a species fixation index (FST) of 0.24. The tree showed that two major branches were formed: one with the three outgroup species and another with the species, the latter split into three minor branches: one with all B. ruziziensis samples; another with all B. decumbens accessions and three of B. brizantha; and the last with two B. brizantha accesses, all commercial cultivars and B. decumbens cv. ‘Basilisk’. It was possible to group, through RAPD, Brachiaria accesses and cultivars. The genetic variability index between species was considered low, and somewhat low when compared with autogamous species. B. brizantha showed the highest genetic variability and the lowest FST, which means that there is a higher intra specific genetic flux than the others.