Capsicum chinense Türüne Ait Biber Popülasyonunun SSR Molekülerleri ile Karakterizasyonu

• Published in: Yüzüncü Yıl Üniversitesi Tarım Bilimleri Dergisi Vol. 31; no. 3; pp. 722 - 732
• Main Authors: TAŞ, Kübra, BALKAYA, Ahmet, UNCU, Ali Tevfik
• Format: Journal Article
• Language: English
• Published: 15.09.2021
• ISSN: 1308-7576
• DOI: 10.29133/yyutbd.928181

Genetik kaynaklarının karakterizasyonu ve çeşitlilik düzeylerinin belirlenmesinde morfolojik tanımlayıcılar ve moleküler analiz yöntemlerinden yararlanılmaktadır. Capsicum chinense biber türü; meyve özellikleri yönünden yüksek düzeyde varyasyon göstermektedir. Bu çalışmada, Capsicum chinense türüne ait biber genetik kaynaklarının (83 genotip) SSR yöntemine göre moleküler karakterizasyonu ile tür içerisindeki mevcut popülasyondaki varyasyon düzeyi ve genetik çeşitlilik düzeylerinin saptanması amaçlanmıştır. Moleküler analizler sonucunda, incelenen 14 SSR primerinden toplam 115 bant elde edilmiştir. Yapılan değerlendirme sonucunda, bantların 66 tanesinin polimorfik (% 57.4) ve 49 tanesinin ise monomorfik (% 42.6) olduğu belirlenmiştir. Capsicum chinense türüne ait biber genotipleri, SSR markörleri ile yapılan moleküler analizler sonucunda Ağırlık atanmamış komşu birleştirme yöntemine göre üç farklı heterojen genetik gruba ayrılmıştır. Ayrıca, C. chinense türüne ait biber genotipleri arasında genetik uzaklık değerlerinin 0.15-0.75 arasında değiştiği bulunmuştur. Bu çalışma sonucunda karakterizasyonu yapılmış olan C. chinense türüne ait biber genotiplerinde halen seleksiyon ıslahı çalışmalarına devam edilmektedir. Morphological descriptors and molecular analysis methods were used to identify plant genetic resources and determine genetic diversity levels. Capsicum chinense has a high variation in terms of fruit traits. In this study, it was aimed to identify the plant characteristics of 83 Capsicum chinense genotypes and to determine genetic diversity levels in the existing population within the species by SSR method. As a result of molecular analysis of genotypes of Capsicum chinense species, a total of 115 bands were obtained from 14 SSR markers. As a result of the evaluation, 66 of the bands were polymorphic (57.4%) and 49 were monomorphic (42.6%). As a result of analyses made with SSR markers in Capsicum chinense genotypes, it was divided into 3 heterotic main groups according to the Unweighted Neighbor-Joining method. Genetic distance values of C. chinense genotypes were found to vary between 0.15-0.75. It is planned to continue selection breeding studies in C. chinense genotypes, which have characterization with this study.