尼罗罗非鱼生长激素促分泌素受体基因（GHSR）生长相关单核苷酸多态性（SNPs）位点的筛选

• Published in: 农业生物技术学报 Vol. 23; no. 6; pp. 762 - 771
• Main Author: 王春晓 卢迈新 高风英 刘志刚 曹建萌 朱华平 可小丽 王淼 叶星 叶卫
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 2015
• Subjects: 单核苷酸多态性位点（SNP）; 尼罗罗非鱼; 生长性状; 生长激素促分泌素受体基因（GSHR）
• ISSN: 1674-7968

本研究用直接测序法,以尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）基础群体和快长群体父母本为材料进行生长激素促分泌素受体基因（growth hormone secretagogue receptor,GHSR）单核苷酸多态性（single nucleotide polymophisms,SNPs）位点的筛选;再以两群体的子代为材料,采用snapshot法对筛选到的SNPs进行基因分型,并利用一般线性模型（general linear model,GLM）对基因型与生长性状进行相关性分析。结果表明,从两个尼罗罗非鱼群体的GHSR基因中共获得S1（A-409G）、S2（G-424T）、S3（T-553A）、S4（T-1114A）和S5（A-1168C）等5个SNPs位点,且均分布于该基因5′侧翼区。SNPs基因型与尼罗罗非鱼子代生长指标关联性分析结果表明,当S4位点为AA或AT基因型时,尼罗罗非鱼个体的体重、体长、体高、头长、尾柄长和尾柄高等生长指标均显著大于S4位点基因型为TT的个体（P〈0.05）,快长群体子代中S4位点AT基因型频率最高（55%）,而在基础群体子代中TT基因型频率最高（75.94%）。5个SNPs位点不同基因型组成了7种双倍型（D1～7）,其中D3和D5双倍型个体的体重、体长、体高、头长、尾柄高等生长指标显著高于D4和D7双倍型个体（P〈0.05）;而D1（体宽除外）、D2（体宽和尾柄长除外）和D6（体高除外）双倍型个体与其他双倍型个体之间在生长指标上均无显著差异（P〉0.05）。快长群体子代和基础群体子代中的优势双倍型分别为D3双倍型（46.25%）和D4双倍型（35.44%）。因此,尼罗罗非鱼GHSR基因中S4位点处AA、AT基因型及双倍型D3、D5与快长性状密切相关,可作为尼罗罗非鱼分子标记辅助育种的候选标记。