毛白杨乙酰-乙酰载体蛋白硫脂酶基因(PtFATB)的克隆与表达分析
植物脂肪酸合成的主要部位是叶绿体,叶绿体向外运输脂肪酸的种类和数量受到乙酰-乙酰载体蛋白硫脂酶(FATB)控制。FATB基因在植物生长过程起着非常关键的作用。本研究以毛白杨为材料,将生物信息学知识和分子生物学手段相结合,首先利用现有的杨树基因组EST序列库资源,通过同源序列搜索,经过多次拼接合并获得了理论的杨树脂肪酸去饱和酶基因PtFATB序列全长,利用RT-PCR手段成功克隆得到了毛白杨FATB基因全长编码序列cDNA,该cDNA全长1,450bp,包括起始密码子ATG和144bp的5'未端非编码区,终止密码子TGA和40bp的3'末端非编码区,开放阅读框编码421个氨基酸。通过RT-PCR...
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Published in | Journal of genetics and genomics Vol. 34; no. 3; pp. 267 - 274 |
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Main Author | |
Format | Journal Article |
Language | Chinese |
Published |
2007
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Subjects | |
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ISSN | 1673-8527 |
Cover
Summary: | 植物脂肪酸合成的主要部位是叶绿体,叶绿体向外运输脂肪酸的种类和数量受到乙酰-乙酰载体蛋白硫脂酶(FATB)控制。FATB基因在植物生长过程起着非常关键的作用。本研究以毛白杨为材料,将生物信息学知识和分子生物学手段相结合,首先利用现有的杨树基因组EST序列库资源,通过同源序列搜索,经过多次拼接合并获得了理论的杨树脂肪酸去饱和酶基因PtFATB序列全长,利用RT-PCR手段成功克隆得到了毛白杨FATB基因全长编码序列cDNA,该cDNA全长1,450bp,包括起始密码子ATG和144bp的5'未端非编码区,终止密码子TGA和40bp的3'末端非编码区,开放阅读框编码421个氨基酸。通过RT-PCR半定量研究了PtFATB在叶片组织中的表达量最高,茎、根中的表达量依次降低。在低温、干旱、NaCl、ABA四种条件下诱导生长24h,只有在低温的条件下发现PtFATB表达量略微降低,其他几种情况未有变化,该结果表明PtFATB呈组成型表达。上述结果为植物脂肪酸的基因工程提供了基础。 |
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Bibliography: | Acyl-acyl carrier protein thioesterase (PtFATB) expression analysis RT-PCR in silico and molecular cloning Populus tomentosa Carr.; Acyl-acyl carrier protein thioesterase (PtFATB); in silico and molecular cloning; RT-PCR; expression analysis Populus tomentosa Carr. 11-5450/R Q592.1 |
ISSN: | 1673-8527 |