长非编码RNA KCNQ1OT1的泛癌分析及其在胃癌中对谷氨酰胺代谢的调控作用

Q522; 长非编码RNA KCNQ1OT1对多种癌症的发生发展中起着重要的促进作用.然而,目前还没有研究在泛癌中对KCNQ1OT1进行系统的分析.本研究通过对KCNQ1OT1在泛癌组织中的表达水平以及对肿瘤患者的预后情况分析,阐明KCNQ1OT1在肿瘤诊断和预后中的价值,通过分析KCNQ1OT1在胃癌中的调控机制,为胃癌的诊疗提供新的分子靶点.使用Sangerbox 3.0、临床生信之家以及UALCAN数据库,发现KCNQ1OT1在7种肿瘤组织中表达增高(均P＜0.05).在Sanger-box 3.0数据库中发现KCNQ1OT1与多种肿瘤的预后不良相关.使用R软件分析胃癌患者中KC-NQ1...

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Published in中国生物化学与分子生物学报 Vol. 41; no. 1; pp. 156 - 168
Main Authors 于亚楠, 李家秋, 马晓林
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 潍坊医学院附属医院肿瘤科,山东潍坊 261031 20.01.2025
Subjects
谷氨酰胺代谢
glutamine metabolism
enhancer
pan-cancer
KCNQ1OT1
生物标志物
泛癌
增强子
biomarker
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ISSN1007-7626
DOI10.13865/j.cnki.cjbmb.2024.12.1242

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Summary:Q522; 长非编码RNA KCNQ1OT1对多种癌症的发生发展中起着重要的促进作用.然而,目前还没有研究在泛癌中对KCNQ1OT1进行系统的分析.本研究通过对KCNQ1OT1在泛癌组织中的表达水平以及对肿瘤患者的预后情况分析,阐明KCNQ1OT1在肿瘤诊断和预后中的价值,通过分析KCNQ1OT1在胃癌中的调控机制,为胃癌的诊疗提供新的分子靶点.使用Sangerbox 3.0、临床生信之家以及UALCAN数据库,发现KCNQ1OT1在7种肿瘤组织中表达增高(均P＜0.05).在Sanger-box 3.0数据库中发现KCNQ1OT1与多种肿瘤的预后不良相关.使用R软件分析胃癌患者中KC-NQ1OT1高表达组和低表达组的差异基因(P＜0.05,|log2FoldChange＞1),并使用基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析发现,KCNQ1OT1参与了胃癌谷氨酰胺的代谢过程.细胞计数和Western印迹检测发现,敲低KCNQ1OT1后胃癌细胞的活性、SLC1A5表达水平以及其介导的谷氨酰胺转运过程均显著下降(P＜0.01).生物信息学、RNA免疫沉淀和双荧光素酶分析验证了 KCNQ1OT1竞争性结合miR-138-5p,并促进SLC1A5的表达.最后,染色质免疫沉淀测序数据检测KCNQ1OT1的基因位点具有高H3K27ac信号,并通过染色质免疫沉淀定量PCR验证了 P300介导的增强子活性调控了胃癌中KCNQ1OT1的高表达.KCNQ1OT1在多种肿瘤中可以作为一种独立的诊断标志物和预后预测因子.靶向KCNQ1OT1/miR-138-5p/SLC1A5信号轴调控的谷氨酰胺代谢,为胃癌的治疗提供了新的策略和分子靶点.
ISSN:1007-7626
DOI:10.13865/j.cnki.cjbmb.2024.12.1242