基于斑马鱼模型和动态分子对接技术探讨西洋参抗缺氧作用及潜在靶点

R285; 本研究利用斑马鱼模型和动态分子对接技术研究西洋参抗缺氧(hypoxia)的作用及潜在靶点.以AB系斑马鱼为实验动物,无水硫酸钠为造模剂诱导形成斑马鱼幼鱼缺氧模型,综合评价西洋参的抗缺氧作用.借助网络药理学技术筛选西洋参活性成分以及缺氧相关共有靶点;并使用STRING平台和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白作用网络图,寻找西洋参抗缺氧可能的潜在靶点;利用动态分子对接技术验证活性成分与关键靶点的结合能力和稳定性.斑马鱼体内实验显示,西洋参提取物可明显增加斑马鱼在缺氧条件下的存活率,减轻因缺氧导致的神经行为状态(P＜0.05),且呈剂量依赖性相关.共筛选获得西洋参7个潜在活...

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Published in天然产物研究与开发 Vol. 35; no. 4; pp. 592 - 601
Main Authors 马智慧, 董榕, 赵焕新, 刘慧茹, 丛媛青, 韩欣颖, 李正国, 韩利文
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 山东省济宁市食品药品检验检测研究院,济宁272027 24.04.2023
山东第一医科大学(山东省医学科学院)药学与制药科学学院,济南250000%山东第一医科大学(山东省医学科学院)药学与制药科学学院,济南250000%山东中医药大学药学院,济南250355
山东中医药大学药学院,济南250355
Subjects
斑马鱼
缺氧
作用靶点
动态分子对接
西洋参
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ISSN1001-6880
DOI10.16333/j.1001-6880.2023.4.005

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Summary:R285; 本研究利用斑马鱼模型和动态分子对接技术研究西洋参抗缺氧(hypoxia)的作用及潜在靶点.以AB系斑马鱼为实验动物,无水硫酸钠为造模剂诱导形成斑马鱼幼鱼缺氧模型,综合评价西洋参的抗缺氧作用.借助网络药理学技术筛选西洋参活性成分以及缺氧相关共有靶点;并使用STRING平台和Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白作用网络图,寻找西洋参抗缺氧可能的潜在靶点;利用动态分子对接技术验证活性成分与关键靶点的结合能力和稳定性.斑马鱼体内实验显示,西洋参提取物可明显增加斑马鱼在缺氧条件下的存活率,减轻因缺氧导致的神经行为状态(P＜0.05),且呈剂量依赖性相关.共筛选获得西洋参7个潜在活性成分和5个抗缺氧潜在靶点;动态分子对接结果显示,西洋参关键活性成分与靶点之间有良好的结合能力,其中TNF、HSP90AA1与活性成分稳定结合,可能为西洋参抗缺氧的关键潜在靶点.综上,本实验建立的斑马鱼幼鱼抗缺氧模型可以快速简便地评价西洋参样品的抗缺氧活性,动态分子对接的结果显示该作用可能通过TNF以及HSP90AA1等靶点发挥作用,为后续西洋参抗缺氧机制研究提供了参考依据.
ISSN:1001-6880
DOI:10.16333/j.1001-6880.2023.4.005