菊芋14-3-3基因家族的鉴定及其对非生物胁迫响应的分析

Q785; [目的]本文旨在鉴定菊芋 14-3-3基因家族成员并分析它们对高温、低温、盐和干旱胁迫响应的表达模式,为研究 14-3-3蛋白功能及菊芋育种提供依据.[方法]采用克隆和生物信息学研究基因性质,采用RNA-seq数据分析和RT-qPCR研究基因对非生物胁迫的响应模式.[结果]从菊芋中克隆到 14-3-3基因家族的 10 个成员HtGRF1—HtGRF10,GenBank登录号为OP132618—OP132627.根据进化关系将其分为2 个亚家族:HtGRF1—HtGRF7 属于非ε组,HtGRF8—HtGRF10 属于ε组,通常形成同源或异源二聚体.组织表达分析表明,HtGRF2/3...

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Published in南京农业大学学报 Vol. 47; no. 3; pp. 477 - 488
Main Authors 任文才, 岳杨, 丁柏水, 高秀美, 周兆胜
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 南京农业大学资源与环境科学学院/江苏省海洋生物学重点实验室,江苏 南京 210095 2024
Subjects
菊芋
14-3-3 protein
gene cloning
组织表达
Jerusalem artichoke(Helianthus tuberosus L.)
非生物胁迫
tissue expression
14-3-3蛋白
基因克隆
abiotic stress
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ISSN1000-2030
DOI10.7685/jnau.202305001

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Summary:Q785; [目的]本文旨在鉴定菊芋 14-3-3基因家族成员并分析它们对高温、低温、盐和干旱胁迫响应的表达模式,为研究 14-3-3蛋白功能及菊芋育种提供依据.[方法]采用克隆和生物信息学研究基因性质,采用RNA-seq数据分析和RT-qPCR研究基因对非生物胁迫的响应模式.[结果]从菊芋中克隆到 14-3-3基因家族的 10 个成员HtGRF1—HtGRF10,GenBank登录号为OP132618—OP132627.根据进化关系将其分为2 个亚家族:HtGRF1—HtGRF7 属于非ε组,HtGRF8—HtGRF10 属于ε组,通常形成同源或异源二聚体.组织表达分析表明,HtGRF2/3/6/9 在芽、根、茎、叶中的表达丰度较高,HtGRF3/5/9 在块茎发育过程中前高后低.综合分析根和叶中HtGRF对非生物胁迫响应时发现,HtGRF6 表达水平在高温、盐和干旱胁迫下下降;HtGRF2/3/7/8/9 表达水平在盐胁迫下下降,而在干旱胁迫下上升;HtGRF1 表达水平在低温胁迫下上升;HtGRF4/5 表达水平在干旱胁迫下下降;而HtGRF10 表达水平变化不显著.[结论]菊芋 14-3-3 蛋白是一个高度保守的多基因编码家族,在菊芋的生长发育和适应复杂环境中起着重要作用.
ISSN:1000-2030
DOI:10.7685/jnau.202305001