普通丝瓜PYL基因家族鉴定及其在果实发育中的表达分析

Q786%S642.4; [目的]探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路.[方法]用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以及基因结构、基因共线性、选择压力、进化亲缘关系和顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR验证在不同浓度ABA下基因特征表达.[结果]在普通丝瓜全基因组中鉴定到11个LcPYL基因,CDS长度576～966 bp,编码蛋白均具有典型PYR_PYL_RCAR_like结构;共线性分析发现7对片段复制基因对,普通丝瓜PYL基因启动子含多个与植物激素相...

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Published in西北植物学报 Vol. 44; no. 3; pp. 408 - 420
Main Authors 王玉倩, 彭丽娟, 刘建汀, 温庆放, 钟凤林, 朱海生
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 福建省农业科学院作物研究所,福州 350013 2024
福建农林大学园艺学院,福州 350002%福建农林大学园艺学院,福州 350002
福建省蔬菜遗传育种重点实验室,福州 350013%福建省农业科学院作物研究所,福州 350013
福建省蔬菜遗传育种重点实验室,福州 350013
Subjects
Luffa cylindrica
PYL gene family
fruit development
PYL基因家族
ABA treatment
expression analysis
外源ABA处理
表达分析
果实发育
普通丝瓜
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ISSN1000-4025
DOI10.7606/j.issn.1000-4025.20230546

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Summary:Q786%S642.4; [目的]探究普通丝瓜PYL基因在ABA处理下的表达模式,以期为深入研究其基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高普通丝瓜品质和产量提供新思路.[方法]用生物信息学方法,对普通丝瓜PYL基因家族进行全基因组鉴定,染色体定位,以及基因结构、基因共线性、选择压力、进化亲缘关系和顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR验证在不同浓度ABA下基因特征表达.[结果]在普通丝瓜全基因组中鉴定到11个LcPYL基因,CDS长度576～966 bp,编码蛋白均具有典型PYR_PYL_RCAR_like结构;共线性分析发现7对片段复制基因对,普通丝瓜PYL基因启动子含多个与植物激素相关的顺式作用元件,其成员的表达具有一定的组织特异性;普通丝瓜果实在不同浓度外源ABA处理下:2 mg/mL ABA处理LcPYLs表达无显著变化,4 mg/mL ABA处理LcPYL5、LcPYL7、LcPYL11显著上调表达,8 mg/mL ABA处理LcPYL1、LcPYL7开花当天显著表达.[结论]对普通丝瓜PYL家族成员进行了系统的鉴定与分析,明确其分子结构特征和表达模式,其中LcPYL1、LcPYL5、LcPYL7和LcPYL1 1可能是与内源ABA生物合成密切相关的关键基因.
ISSN:1000-4025
DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.20230546