基于基因表达综合数据库芯片挖掘结合网络药理学与分子对接探讨芒果苷治疗口腔黏膜下纤维化的机制研究

R781.5; 目的 基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制.方法 基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾病靶标,使用EVenn平台绘制维恩图,STRING数据库绘制蛋白质互作(PPI)网络,DAVID平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,Cytoscape 3.10.1软件绘制药物—靶标—通路—疾病网络图,AutoDocktools 1.5.6软件进行分子对接分析及可视化.结果 从多种数据库挖掘得到MF潜在靶...

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Published in华西口腔医学杂志 Vol. 42; no. 4; pp. 444 - 451
Main Authors 宋子毅, 杨超, 张云龙, 张柱江, 任天娇, 张欣悦, 李雪
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 齐齐哈尔医学院口腔医学院,齐齐哈尔 161006%齐齐哈尔医学院医学技术学院,齐齐哈尔 161006%齐齐哈尔医学院公共卫生学院,齐齐哈尔 161006%齐齐哈尔医学院基础医学院,齐齐哈尔 161006 01.08.2024
Subjects
网络药理学
oral submucous fibrosis
molecular docking
network pharmacology
口腔黏膜下纤维化
Gene Expression Omnibus database
芒果苷
mangiferin
基因表达综合数据库
分子对接
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Summary:R781.5; 目的 基于基因表达综合(GEO)数据库芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术探讨芒果苷(MF)治疗口腔黏膜下纤维化(OSF)的核心作用靶标及潜在作用机制.方法 基于GEO芯片挖掘OSF的潜在治疗靶点,利用数据库预测MF潜在作用靶标和收集OSF疾病靶标,使用EVenn平台绘制维恩图,STRING数据库绘制蛋白质互作(PPI)网络,DAVID平台进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,Cytoscape 3.10.1软件绘制药物—靶标—通路—疾病网络图,AutoDocktools 1.5.6软件进行分子对接分析及可视化.结果 从多种数据库挖掘得到MF潜在靶标356个,OSF疾病靶标360个,选取PPI网络中排名前15个关键靶蛋白,GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,MF治疗OSF主要涉及高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、表皮生长因子受体(EGFR)等信号通路.分子对接显示,MF与丝氨酸蛋白激酶(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)等核心靶点有较佳结合活性.结论 MF可能通过多靶点、多途径的方式对OSF发挥治疗作用.
ISSN:1000-1182
DOI:10.7518/hxkq.2024.2024050