M2巨噬细胞特征基因风险评分能准确预测HBV相关肝细胞癌患者的预后

目的 探讨在乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)中M2巨噬细胞特征基因(MRG)对患者预后的评估价值及潜在的分子机制.方法 从TCGA数据库获取73例HBV相关肝HCC患者的转录组数据,通过WGCNA识别M2巨噬细胞相关基因模块,利用LASSO鉴定出关键MRG并构建风险评分,并在外部数据集中验证风险评分的预测性能.应用CIBERSORT和R.pRRophetic分析风险评分与免疫细胞浸润、药物敏感性的关系.通过GSVA和GSEA对高风险组和低风险组的差异基因进行通路富集分析.R.Seurat验证在HCC中表达MRG的细胞类型,并通过R.Cellchat分析细胞互作强度,找到与HCC进展...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in南方医科大学学报 Vol. 44; no. 5; pp. 827 - 840
Main Authors 刘鹏程, 娄丽娟, 刘霞, 王建, 姜颖
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 军事科学院//军事医学研究院,北京 102206 2024
Subjects
M2 macrophages
肝细胞癌
prognostic model
hepatitis B virus
M2巨噬细胞
预后模型
hepatocellular carcinoma
乙型肝炎病毒
Online AccessGet full text

Cover

More Information
Summary:目的 探讨在乙型肝炎病毒(HBV)相关肝细胞癌(HCC)中M2巨噬细胞特征基因(MRG)对患者预后的评估价值及潜在的分子机制.方法 从TCGA数据库获取73例HBV相关肝HCC患者的转录组数据,通过WGCNA识别M2巨噬细胞相关基因模块,利用LASSO鉴定出关键MRG并构建风险评分,并在外部数据集中验证风险评分的预测性能.应用CIBERSORT和R.pRRophetic分析风险评分与免疫细胞浸润、药物敏感性的关系.通过GSVA和GSEA对高风险组和低风险组的差异基因进行通路富集分析.R.Seurat验证在HCC中表达MRG的细胞类型,并通过R.Cellchat分析细胞互作强度,找到与HCC进展相关的重要细胞类型.流式细胞术检测肝癌条件培养基诱导THP-1向M2样极化,RT-qPCR验证MRG在HBV阳性的肝癌细胞系和M2巨噬细胞中表达.结果 M2巨噬细胞高浸润状态与患者不良预后显著相关(P=0.025).高风险组的总生存期(OS)均显著低于低风险组(训练集P=0.021,测试集P=0.046).高风险组中M2巨噬细胞显著富集(P=0.03),低风险组中幼稚B细胞显著富集(P=0.049).药物BI.2536对高风险组更有效(P=0.025),AG.014699(P=0.044)、AKT.inhibitor.Ⅷ(P=0.041)、AZD.0530(P=0.0033)、AZD7762(P=0.0051)和BMS.708163(P=0.015)对低风险组更有效.通路富集分析结果表明,增殖相关通路和代谢相关通路在高风险组中富集.单核细胞在高风险组HCC进展的细胞互作中最为活跃.VTN在PLC/PRF/5中的表达显著上调(P<0.0001),GCLC、PARVB、TRIM27和GMPR在M2样THP-1中的表达显著上调(P=0.0037、P=0.0015、P=0.0071、P=0.0004).结论 MRG风险评分能准确预测HBV相关HCC患者的预后,揭示其肿瘤微环境的差异,为HCC患者的精准治疗提供了指导.
ISSN:1673-4254
DOI:10.12122/j.issn.1673-4254.2024.05.04