广东地区口蹄疫病毒VP1和3A基因的序列分析

S852.65; [目的]了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)的遗传变异情况,为我国FMDV流行病学的研究及防控提供基础数据.[方法]对2015—2016年间收集的广东地区猪的病料进行FMDV VP1和3A基因的扩增测序和序列分析.[结果]11株O型FMDV均属耿马谱系毒株,7株A型FMDV均属Asia型毒株.11株O型FMDV的VP1基因与流行毒株相比,GD-MM-3株与O/BY/CHA/2010株序列相似性最高,为95.3%;GD-1株、GD-MM-1株和GD-MM-3株与O/MYA/1/98株序列相似性最高,为90.8%.7株A型FMDV的VP1基因与流行毒株相比, A/GDMM/CHA/...

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Published in华南农业大学学报 Vol. 39; no. 3; pp. 13 - 18
Main Authors 李琪, 谢增胜, 石庆伟, 陈耀, 孙彦阔, 冯松林, 汪志, 冀池海, 刘艺兴, 邢秀琳, 张桂红
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 华南农业大学 兽医学院/广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广东 广州,510642%华南农业大学 兽医学院/广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室,广东 广州 510642 01.05.2018
中山广食农牧发展有限公司,广东 中山 528451
Subjects
序列相似性
遗传变异
口蹄疫病毒
VP1基因
VP1 gene
3A基因
foot-and-mouth disease virus
genetic variation
sequence similarity
3A gene
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ISSN1001-411X
DOI10.7671/j.issn.1001-411X.2018.03.003

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Summary:S852.65; [目的]了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)的遗传变异情况,为我国FMDV流行病学的研究及防控提供基础数据.[方法]对2015—2016年间收集的广东地区猪的病料进行FMDV VP1和3A基因的扩增测序和序列分析.[结果]11株O型FMDV均属耿马谱系毒株,7株A型FMDV均属Asia型毒株.11株O型FMDV的VP1基因与流行毒株相比,GD-MM-3株与O/BY/CHA/2010株序列相似性最高,为95.3%;GD-1株、GD-MM-1株和GD-MM-3株与O/MYA/1/98株序列相似性最高,为90.8%.7株A型FMDV的VP1基因与流行毒株相比, A/GDMM/CHA/2013株与GD-3株序列相似性最高,为99.8%;A/HuBWH/CHA/2009株与GD-3株序列相似性最高,为91.4%.11株O型FMDV的3A蛋白不存在氨基酸的缺失,7株A型FMDV的3A蛋白存在较多氨基酸的缺失.[结论]广东部分地区FMDV基因型复杂,预防控制困难.
ISSN:1001-411X
DOI:10.7671/j.issn.1001-411X.2018.03.003