枳LEA基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应
S666; 为明确LEA基因在枳非生物胁迫中的作用,研究通过生物信息学方法对枳LEA 基因家族进行全基因组的鉴定,并采用 qRT-PCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达情况.结果表明:(1)枳基因组中鉴定得到 57 个LEA基因家族成员,编码蛋白的氨基酸长度在 62～945 aa 之间,分子质量在 6.95～104.98 kD之间.(2)系统进化分析表明,PtrLEA基因可分为 8 个亚家族,LEA_1～LEA_6、dehydrin和 SMP,LEA_2 亚族家族成员最多.(3)顺式作用元件分析表明,PtrLEA启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育有关的响应元件.(4)转录组数据...
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| Published in | 西北植物学报 Vol. 43; no. 6; pp. 918 - 928 |
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| Main Authors | , , , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
赣南师范大学 生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000
2023
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| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1000-4025 |
| DOI | 10.7606/j.issn.1000-4025.2023.06.0918 |
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| Abstract | S666; 为明确LEA基因在枳非生物胁迫中的作用,研究通过生物信息学方法对枳LEA 基因家族进行全基因组的鉴定,并采用 qRT-PCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达情况.结果表明:(1)枳基因组中鉴定得到 57 个LEA基因家族成员,编码蛋白的氨基酸长度在 62～945 aa 之间,分子质量在 6.95～104.98 kD之间.(2)系统进化分析表明,PtrLEA基因可分为 8 个亚家族,LEA_1～LEA_6、dehydrin和 SMP,LEA_2 亚族家族成员最多.(3)顺式作用元件分析表明,PtrLEA启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育有关的响应元件.(4)转录组数据分析结果显示,LEA基因家族具有组织表达特异性,PtrLEA15、PtrLEA17、PtrLEA23、PtrLEA51 在所有组织中均有高表达,也发现有 3 个基因在所有组织中不表达.(5)实时荧光定量PCR结果显示:PtrLEA 基因在低温、干旱和高盐胁迫处理条件下,与对照相比分别有 6、2 和 6 个基因上调表达,推测该基因家族参与多种非生物胁迫应答. |
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| AbstractList | S666; 为明确LEA基因在枳非生物胁迫中的作用,研究通过生物信息学方法对枳LEA 基因家族进行全基因组的鉴定,并采用 qRT-PCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达情况.结果表明:(1)枳基因组中鉴定得到 57 个LEA基因家族成员,编码蛋白的氨基酸长度在 62～945 aa 之间,分子质量在 6.95～104.98 kD之间.(2)系统进化分析表明,PtrLEA基因可分为 8 个亚家族,LEA_1～LEA_6、dehydrin和 SMP,LEA_2 亚族家族成员最多.(3)顺式作用元件分析表明,PtrLEA启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育有关的响应元件.(4)转录组数据分析结果显示,LEA基因家族具有组织表达特异性,PtrLEA15、PtrLEA17、PtrLEA23、PtrLEA51 在所有组织中均有高表达,也发现有 3 个基因在所有组织中不表达.(5)实时荧光定量PCR结果显示:PtrLEA 基因在低温、干旱和高盐胁迫处理条件下,与对照相比分别有 6、2 和 6 个基因上调表达,推测该基因家族参与多种非生物胁迫应答. |
| Author | 钟静 张晓媛 佟晓楠 李兴涛 陈凯 范丽珍 |
| AuthorAffiliation | 赣南师范大学 生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000 |
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| Author_FL | FAN Lizhen CHEN Kai TONG Xiaonan LI Xingtao ZHONG Jing ZHANG Xiaoyuan |
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| DBID | 2B. 4A8 92I 93N PSX TCJ |
| DOI | 10.7606/j.issn.1000-4025.2023.06.0918 |
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| DocumentTitle_FL | Genome-wide Identification and Abiotic Stress Responses of LEA Gene Family in Poncirus trifoliata |
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| ISSN | 1000-4025 |
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| Issue | 6 |
| Keywords | Poncirus trifoliata adversity response 枳 LEA gene family 逆境响应 LEA基因家族 expression mode 表达模式 |
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| PublicationDecade | 2020 |
| PublicationTitle | 西北植物学报 |
| PublicationTitle_FL | Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica |
| PublicationYear | 2023 |
| Publisher | 赣南师范大学 生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000 |
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| Title | 枳LEA基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应 |
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