枳LEA基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应

S666; 为明确LEA基因在枳非生物胁迫中的作用,研究通过生物信息学方法对枳LEA 基因家族进行全基因组的鉴定,并采用 qRT-PCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达情况.结果表明:(1)枳基因组中鉴定得到 57 个LEA基因家族成员,编码蛋白的氨基酸长度在 62～945 aa 之间,分子质量在 6.95～104.98 kD之间.(2)系统进化分析表明,PtrLEA基因可分为 8 个亚家族,LEA_1～LEA_6、dehydrin和 SMP,LEA_2 亚族家族成员最多.(3)顺式作用元件分析表明,PtrLEA启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育有关的响应元件.(4)转录组数据...

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Published in西北植物学报 Vol. 43; no. 6; pp. 918 - 928
Main Authors 陈凯, 佟晓楠, 张晓媛, 范丽珍, 钟静, 李兴涛
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 赣南师范大学 生命科学学院,国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000 2023
Subjects
Poncirus trifoliata
adversity response
枳
LEA gene family
逆境响应
LEA基因家族
expression mode
表达模式
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Summary:S666; 为明确LEA基因在枳非生物胁迫中的作用,研究通过生物信息学方法对枳LEA 基因家族进行全基因组的鉴定,并采用 qRT-PCR技术分析其在不同非生物胁迫下的表达情况.结果表明:(1)枳基因组中鉴定得到 57 个LEA基因家族成员,编码蛋白的氨基酸长度在 62～945 aa 之间,分子质量在 6.95～104.98 kD之间.(2)系统进化分析表明,PtrLEA基因可分为 8 个亚家族,LEA_1～LEA_6、dehydrin和 SMP,LEA_2 亚族家族成员最多.(3)顺式作用元件分析表明,PtrLEA启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育有关的响应元件.(4)转录组数据分析结果显示,LEA基因家族具有组织表达特异性,PtrLEA15、PtrLEA17、PtrLEA23、PtrLEA51 在所有组织中均有高表达,也发现有 3 个基因在所有组织中不表达.(5)实时荧光定量PCR结果显示:PtrLEA 基因在低温、干旱和高盐胁迫处理条件下,与对照相比分别有 6、2 和 6 个基因上调表达,推测该基因家族参与多种非生物胁迫应答.
ISSN:1000-4025
DOI:10.7606/j.issn.1000-4025.2023.06.0918