基于YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC的头颈部鳞状细胞癌N6-甲基腺苷风险模型构建及临床应用评估

Q786; 目的 利用生物信息学技术构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)N6-甲基腺苷(m6A)调节因子模型,进行预后及肿瘤免疫微环境评估.方法 利用R语言对癌症基因组图谱(TCGA)数据库HNSCC患者进行m6A调节因子风险预后模型构建,然后对不同风险组进行差异基因分析、细胞类型富集分析和临床相关性分析.结果 HNSCC中15个m6A调节因子表达异常,根据异常表达基因构建了HNSCC YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC三基因独立预后风险模型,其中高风险组免疫抑制相关因子及免疫细胞显著增多,抗肿瘤免疫相关因子及免疫细胞减少,呈现促肿瘤的免疫微环境.结论 联合YTHDC2、IGF2BP2和...

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Published in华西口腔医学杂志 Vol. 40; no. 6; pp. 704 - 709
Main Authors 岳蔷薇, 徐乐, 张东升
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 山东第一医科大学附属省立医院口腔科,济南250021 01.12.2022
Subjects
肿瘤免疫微环境
N6-甲基腺苷
生物信息学分析
头颈部鳞状细胞癌
预后风险模型
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ISSN1000-1182
DOI10.7518/hxkq.2022.06.012

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Summary:Q786; 目的 利用生物信息学技术构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)N6-甲基腺苷(m6A)调节因子模型,进行预后及肿瘤免疫微环境评估.方法 利用R语言对癌症基因组图谱(TCGA)数据库HNSCC患者进行m6A调节因子风险预后模型构建,然后对不同风险组进行差异基因分析、细胞类型富集分析和临床相关性分析.结果 HNSCC中15个m6A调节因子表达异常,根据异常表达基因构建了HNSCC YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC三基因独立预后风险模型,其中高风险组免疫抑制相关因子及免疫细胞显著增多,抗肿瘤免疫相关因子及免疫细胞减少,呈现促肿瘤的免疫微环境.结论 联合YTHDC2、IGF2BP2和HNRNPC的m6A调节因子风险预后模型可以有效评估HNSCC患者预后及肿瘤免疫浸润状态.
ISSN:1000-1182
DOI:10.7518/hxkq.2022.06.012