鳙长江中下游群体的D-loop序列遗传分析

S917.4; 为了探究长江中下游鳙的种质遗传现状,该研究收集了石首(SS)、长沙(CS)、瑞昌(RC)、扬州(YZ)和张家港(ZJG)的长江种群(YR,219尾),对其D-loop序列进行检测分析,并结合NCBI下载整理的珠江种群(PR,213尾)和北美种群(NA,33尾)开展比较研究.结果显示,在YR、PR和NA的D-loop序列中分别检测到35、96和11个变异位点,并分别界定37、62和3个单倍型.在长江中下游的5个鳙群体中,单倍型多样性(Hd)为0.798～0.897,核苷酸多样性(π)为0.003 38～0.006 53.长江中下游5个鳙群体间,RC与ZJG(FST=0.012)和...

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Published in上海海洋大学学报 Vol. 33; no. 3; pp. 521 - 532
Main Authors 傅建军, 朱文彬, 罗明坤, 王兰梅, 董在杰
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心 农业农村部淡水渔业与种质资源利用重点实验室,江苏无锡 214081 01.05.2024
Subjects
线粒体DNA
population diversity
种群多样性
mitochondrial DNA
鳙
遗传分化
genetic differentiation
D-loop序列
Hypophthalmichthys nobilis
D-loop sequence
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ISSN1674-5566
DOI10.12024/jsou.20231104342

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Summary:S917.4; 为了探究长江中下游鳙的种质遗传现状,该研究收集了石首(SS)、长沙(CS)、瑞昌(RC)、扬州(YZ)和张家港(ZJG)的长江种群(YR,219尾),对其D-loop序列进行检测分析,并结合NCBI下载整理的珠江种群(PR,213尾)和北美种群(NA,33尾)开展比较研究.结果显示,在YR、PR和NA的D-loop序列中分别检测到35、96和11个变异位点,并分别界定37、62和3个单倍型.在长江中下游的5个鳙群体中,单倍型多样性(Hd)为0.798～0.897,核苷酸多样性(π)为0.003 38～0.006 53.长江中下游5个鳙群体间,RC与ZJG(FST=0.012)和CS与YZ(FST=0.018)的遗传分化不显著,其余群体间均存在显著遗传分化(FST为0.031～0.125);群体间检测到不同程度的基因流(Nm为3.509～39.993).基于单倍型网络分析,长江中下游的鳙D-loop序列单倍型存在多个分支,并在群体间存在明显的共享;YR和PR的中心单倍型存在广泛共享,PR的特有单倍型均为外围单倍型,并推测NA的形成存在不同的遗传来源.基于中性检验结果,推测PR在历史上经历过种群扩张.研究表明,长江和珠江的鳙种群维持了较高的遗传多样性,可为其种质资源保护和利用奠定物质基础.
ISSN:1674-5566
DOI:10.12024/jsou.20231104342