黑龙江立克次体感染对小鼠脾脏免疫相关基因转录的影响

R376.3; 目的 分析黑龙江立克次体感染小鼠脾脏免疫相关基因的转录变化,筛选影响黑龙江立克次体感染致病进程的关键靶标.方法 取20只雌性C3H/HeN小鼠,随机分为未感染组(0 hpi)、感染3 h组(3 hpi)、感染3 d组(3 dpi)及感染6 d组(6 dpi),每组5只,采用尾静脉注射法感染黑龙江立克次体,在4个时相点解剖小鼠取脾,提取总RNA进行测序,筛选出特异性转录基因并进行GO注释、R语言富集及KEGG可视化功能分析.结果 小鼠感染黑龙江立克次体后,脾脏有219930个mRNA发生了特异性转录,通过GO注释及富集筛选出显著性变化的3类基因:(1)35个天然免疫相关基因,其中...

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Published in解放军医学杂志 Vol. 47; no. 4; pp. 326 - 333
Main Authors 于永慧, 段长松, 焦俊, 赵月峨, 周冬生, 温博海, 欧阳譞, 熊小路
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室,北京 100071 2022
Subjects
天然免疫
立克次体感染
黑龙江立克次体
获得性免疫
炎症反应
转录,遗传
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Summary:R376.3; 目的 分析黑龙江立克次体感染小鼠脾脏免疫相关基因的转录变化,筛选影响黑龙江立克次体感染致病进程的关键靶标.方法 取20只雌性C3H/HeN小鼠,随机分为未感染组(0 hpi)、感染3 h组(3 hpi)、感染3 d组(3 dpi)及感染6 d组(6 dpi),每组5只,采用尾静脉注射法感染黑龙江立克次体,在4个时相点解剖小鼠取脾,提取总RNA进行测序,筛选出特异性转录基因并进行GO注释、R语言富集及KEGG可视化功能分析.结果 小鼠感染黑龙江立克次体后,脾脏有219930个mRNA发生了特异性转录,通过GO注释及富集筛选出显著性变化的3类基因:(1)35个天然免疫相关基因,其中参与γ干扰素(IFN-γ)信号通路的irg1、gbp10基因转录上调最明显(P<0.05);(2)31个获得性免疫相关基因,其中参与细胞凋亡通路的gzmb基因转录上调最明显(P<0.05);(3)41个炎症反应相关基因,其中参与细胞因子与细胞因子受体信号通路的ccl4基因转录上调最明显(P<0.05).结论 宿主IFN-γ信号通路中的irg1、gbp10基因,细胞凋亡通路中的gzmb基因,细胞因子及细胞因子受体信号通路中的ccl4基因影响黑龙江立克次体感染的致病进程.
ISSN:0577-7402
DOI:10.11855/j.issn.0577-7402.2022.04.0326