参照多重PCR片段分析法进行实时荧光PCR法对ABCB1三等位基因测定结果读取方法的确定
R749; 目的 为解决实时荧光PCR法对三等位基因测定结果无法正常读取的问题,通过参照多重PCR片段分析法,确定实时荧光PCR法读取方法,实现临床对ABCB1三等位基因准确、简便且价格低廉的检测.方法 收集西安市精神卫生中心2020年3月-2021年3月DNA样本2794例,抽取5％作为实验样本,分别进行实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法测定.根据PCR曲线Ct值的比较以及多重PCR片段分析法碱基峰位强度的比较,对比分析两种方法的判读结果,对其中报告结果不相同的样本进行数据核查并确定PCR读取方法.结果 共抽取139例样本,其中存在120例等位基因及19例三等位基因,实时荧光PCR法和多...
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| Published in | 四川精神卫生 Vol. 35; no. 2; pp. 137 - 143 |
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| Main Authors | , , , , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100%西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100
2022
西安市精神卫生中心,陕西 西安 710100 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1007-3256 |
| DOI | 10.11886/scjsws20210908004 |
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| Abstract | R749; 目的 为解决实时荧光PCR法对三等位基因测定结果无法正常读取的问题,通过参照多重PCR片段分析法,确定实时荧光PCR法读取方法,实现临床对ABCB1三等位基因准确、简便且价格低廉的检测.方法 收集西安市精神卫生中心2020年3月-2021年3月DNA样本2794例,抽取5％作为实验样本,分别进行实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法测定.根据PCR曲线Ct值的比较以及多重PCR片段分析法碱基峰位强度的比较,对比分析两种方法的判读结果,对其中报告结果不相同的样本进行数据核查并确定PCR读取方法.结果 共抽取139例样本,其中存在120例等位基因及19例三等位基因,实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法对等位基因的检测结果完全一致.根据多重PCR片段分析结果,对19例三等位基因制定了实时荧光PCR法的读取方法:扩增曲线图中,当∣∣Ct.G-Ct.T∣-∣Ct.G-Ct.A∣∣<3,分别读取两组碱基Ct值小的碱基,将其组合形成判读结果;当∣∣Ct.G-Ct.T∣-∣Ct.G-Ct.A∣∣≥3,读取两组碱基Ct值最小的碱基,其纯合型即为判读结果.根据读取方法,修正实时荧光PCR法的测定结果为:1例G/G,1例A/A,4例T/G,5例T/A,8例T/T,与多重PCR片段分析法结果一致.结论 通过多重PCR片段分析法制定实时荧光PCR法对ABCB1三等位基因的读取方法,两者判读结果一致性良好. |
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| AbstractList | R749; 目的 为解决实时荧光PCR法对三等位基因测定结果无法正常读取的问题,通过参照多重PCR片段分析法,确定实时荧光PCR法读取方法,实现临床对ABCB1三等位基因准确、简便且价格低廉的检测.方法 收集西安市精神卫生中心2020年3月-2021年3月DNA样本2794例,抽取5％作为实验样本,分别进行实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法测定.根据PCR曲线Ct值的比较以及多重PCR片段分析法碱基峰位强度的比较,对比分析两种方法的判读结果,对其中报告结果不相同的样本进行数据核查并确定PCR读取方法.结果 共抽取139例样本,其中存在120例等位基因及19例三等位基因,实时荧光PCR法和多重PCR片段分析法对等位基因的检测结果完全一致.根据多重PCR片段分析结果,对19例三等位基因制定了实时荧光PCR法的读取方法:扩增曲线图中,当∣∣Ct.G-Ct.T∣-∣Ct.G-Ct.A∣∣<3,分别读取两组碱基Ct值小的碱基,将其组合形成判读结果;当∣∣Ct.G-Ct.T∣-∣Ct.G-Ct.A∣∣≥3,读取两组碱基Ct值最小的碱基,其纯合型即为判读结果.根据读取方法,修正实时荧光PCR法的测定结果为:1例G/G,1例A/A,4例T/G,5例T/A,8例T/T,与多重PCR片段分析法结果一致.结论 通过多重PCR片段分析法制定实时荧光PCR法对ABCB1三等位基因的读取方法,两者判读结果一致性良好. |
| Author | 邢欢 杨柳 郑璇 蒙卓成 戴尊孝 张燕 崔小花 |
| AuthorAffiliation | 西安市精神卫生中心,陕西 西安 710100;西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100%西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100 |
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| Author_FL | Cui Xiaohua Zhang Yan Dai Zunxiao Xing Huan Zheng Xuan Meng Zhuocheng Yang Liu |
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| DOI | 10.11886/scjsws20210908004 |
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| DocumentTitle_FL | Interpretation of results obtained using real-time fluorescence PCR based on multiplex PCR fragment analysis for ABCB1 tri-allele |
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| Issue | 2 |
| Keywords | 实时荧光PCR法 ABCB1 三等位基因 多重PCR片段分析 |
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| PublicationTitle | 四川精神卫生 |
| PublicationTitle_FL | Sichuan Mental Health |
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| Publisher | 西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100%西安市药学(精神卫生)重点实验室,陕西 西安 710100 西安市精神卫生中心,陕西 西安 710100 |
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