花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• Published in: 作物学报 Vol. 50; no. 4; pp. 932 - 943
• Main Authors: 李海芬, 鲁清, 刘浩, 温世杰, 王润风, 黄璐, 陈小平, 洪彦彬, 梁炫强
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广东省农业科学院作物研究所/广东省农作物遗传改良重点实验室/国家油料作物改良中心南方花生分中心,广东广州 510640 2024
• Subjects: 生物信息学; the relative expression analysis; GA3ox; 功能分析; functional analysis; 表达分析; bioinformatics; peanut; 花生
• ISSN: 0496-3490
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2024.34122

赤霉素 3-β-双加氧酶(gibberellin 3-beta-dioxygenase,GA3ox)是参与赤霉素生物合成的关键酶之一,可通过影响赤霉素的形成调控植物的生长发育,目前在花生中尚无系统研究.本研究利用生物信息学方法在花生栽培种基因组数据库中筛选花生GA3ox家族基因,对鉴定出的7个AhGA3ox在栽培种花生基因组中的分布、结构及进化特征、理化性质、启动子顺式作用元件进行分析,并利用 qRT-PCR 技术对其进行花生组织结构表达模式分析,同时对AhGA3ox家族基因在不同荚果大小的 2 个花生品系中的表达量进行分析.结果表明,7 个AhGA3ox基因分布在 7 条染色体上,均由1个内含子和2个外显子组成.花生AhGA3ox蛋白中均包含1个DIOX_N结构域和1个2OG-FeII_Oxy结构域,系统进化分析表明与大豆的亲缘关系较近,在根、茎、叶、花、果针 5 个组织中呈现出不同表达模式,不仅在花生果壳不同发育时期的表达量不同,在 2 个荚果大小不同的花生品系果壳相同发育时期的表达量也不相同,但多数发育时期在大果品系中的表达量均显著高于小果品系,推测该家族基因的表达可能对荚果的形成具有促进作用.