不同马铃薯淀粉含量差异的转录组学解析

淀粉是马铃薯重要的品质性状之一,广泛应用于食品、医药、石油化工等行业,市场上对高淀粉马铃薯品种的需求逐年提高.为探究马铃薯块茎淀粉积累特性及调控的关键基因,本研究通过RNA测序分析,分别对高、低淀粉含量马铃薯品种大西洋(DXY)、定薯1号(DS1)的匍匐茎(a)、块茎膨大前期(b)、块茎膨大中期(c)、块茎膨大后期(d)及成熟期(e)进行转录组谱分析,5个时期共获得9494个差异表达基因(DEGs),结合功能注释发现差异基因主要富集在结合绑定和催化活性等分子功能中,代谢通路分析发现差异基因主要富集在碳水化合物途径中,其中有137个DEGs与淀粉和蔗糖代谢相关.筛选获得9个调控淀粉合成关键基因,...

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Published in作物学报 Vol. 50; no. 6; pp. 1503 - 1513
Main Authors 赵娜, 刘宇曦, 张朝澍, 石瑛
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨 150030 12.06.2024
东北农业大学农学院,黑龙江哈尔滨 150030
Subjects
developmental period
发育时期
accumulation of starch synthesis
transcriptome sequencing
potato
淀粉合成积累
转录组测序
马铃薯
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ISSN0496-3490
DOI10.3724/SP.J.1006.2024.34172

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Summary:淀粉是马铃薯重要的品质性状之一,广泛应用于食品、医药、石油化工等行业,市场上对高淀粉马铃薯品种的需求逐年提高.为探究马铃薯块茎淀粉积累特性及调控的关键基因,本研究通过RNA测序分析,分别对高、低淀粉含量马铃薯品种大西洋(DXY)、定薯1号(DS1)的匍匐茎(a)、块茎膨大前期(b)、块茎膨大中期(c)、块茎膨大后期(d)及成熟期(e)进行转录组谱分析,5个时期共获得9494个差异表达基因(DEGs),结合功能注释发现差异基因主要富集在结合绑定和催化活性等分子功能中,代谢通路分析发现差异基因主要富集在碳水化合物途径中,其中有137个DEGs与淀粉和蔗糖代谢相关.筛选获得9个调控淀粉合成关键基因,其中蔗糖合酶基因PGSC0003DMG400013547在大西洋整个生育期表达量较高,且在各时期表达量均高于定薯1号;果糖激酶基因PGSC0003DMG400026916在a、b时期大西洋的表达量显著高于定薯1号;定薯1号中淀粉酶基因PGSC0003DMG400009891、PGSC0003DMG400001549和葡聚糖内切-1,3-β-葡萄糖苷酶基因PGSC0003DMG400024642、PGSC0003DMG400003181分别在c和e时期表达量显著高于高淀粉品种大西洋.上述基因可能是参与淀粉的合成与积累的关键调控基因.本研究为不同类型马铃薯品种块茎淀粉代谢调控机制研究提供参考.
ISSN:0496-3490
DOI:10.3724/SP.J.1006.2024.34172