鲑降钙素对虹鳟鳞组织miRNA表达的影响

• Published in: 水产学报 Vol. 48; no. 3; pp. 44 - 55
• Main Authors: 周启苓, 马骞, 王刘永, 毛非凡, 杨二军, 陈刚
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 广东海洋大学,南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江),广东湛江 524025 01.03.2024; 广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025%广东海洋大学水产学院,广东湛江 524025
• Subjects: 鲑降钙素; 虹鳟; scales; salmon calcitonin; bone matebolism; miRNA; 骨代谢; Oncorhynchus mykiss; 鳞; 钙代谢; calcium metabolism
• ISSN: 1000-0615
• DOI: 10.11964/jfc.20210913059

S917.4; miRNA作为一类非编码小RNA分子,在脊椎动物骨代谢的分子调控网络中占有重要地位.本研究旨在探究钙调节因子对硬骨鱼类骨组织miRNA表达水平的影响.采用鲑降钙素(salmon calcitonin,sCT)对虹鳟幼鱼进行腹腔注射,并在注射 24h后采集鳞片,利用高通量测序技术和生物信息学方法对其中的miRNA表达谱进行分析.注射组及对照组样品miRNA测序分别获得 14 051 631 和 15 816 147 条高质量miRNA序列(18～26 nt),并分别从中鉴定出 568 和 592 种成熟miRNA.注射sCT后的虹鳟鳞片中共筛选出 24 个差异表达miRNA(DEMs,其中 9 个表达上调,15 个表达下调).随后,从中随机选取 8 个miRNA进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,其检测结果与高通量测序结果一致.GO注释和富集分析结果显示,DEMs的预测靶基因主要被注释在金属离子结合、钙离子结合、G蛋白偶联受体信号通路、Wnt信号通路和经典Wnt信号通路等功能上,靶基因主要在NF-kappaB输入细胞核的负调节、IL-1β分泌的负调节和TGF-β结合等功能上显著富集.KEGG富集分析结果显示,DEMs的靶基因显著富集在Toll样受体和雌激素等信号通路中.基于上述分析结果,本研究筛选出omy-miR-29a-5p、omy-miR-30d-5p、omy-mir-125b-2-p3、omy-miR-138、omy-miR-199b-5p和omy-miR-200b等多个可能参与虹鳟骨代谢调控过程的miRNA.本实验筛选出的差异miRNA可为硬骨鱼类骨代谢调控机制研究提供素材.