脂肪非典型钙黏蛋白1基因在胰腺癌中的表达及临床意义

目的:探讨脂肪非典型钙黏蛋白1（FAT1）基因在胰腺癌中的表达情况及其与胰腺癌的临床病理特征、预后及免疫治疗的关系。方法:（1）生物信息学分析：基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库中179例胰腺癌的FAT1 mRNA表达和临床数据、基因型-组织表达（GTEx）数据库中328例正常胰腺组织的FAT1 mRNA表达数据，分析胰腺癌和正常胰腺组织中FAT1 mRNA的表达差异及FAT1 mRNA表达与胰腺癌分化程度、临床分期、预后、免疫细胞浸润、免疫检查点关联基因的关系，应用Limma 3.40.2软件包分析FAT1相关差异表达基因，并对差异表达基因进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Published in中华肿瘤杂志 Vol. 46; no. 11; pp. 1029 - 1037
Main Authors 刘鑫源, 杨莹, 杨朝丹, 马政霄, 吴聪慧, 徐陈, 朱蕊, 刘盼, 应莉莎, 尹文娟, 苏丹
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 浙江中医药大学第二临床医学院，杭州310053%中国科学院大学杭州高等研究院分子医学院，杭州310024%浙江省肿瘤医院　中国科学院杭州医学研究所病理科，杭州310022 23.11.2024
Subjects
Immune microenvironment
脂肪非典型钙黏蛋白1
生物信息学
Prognosis
FAT atypical cadherin 1
预后
免疫微环境
胰腺肿瘤
Bioinformatics
Pancreatic neoplasms
Online AccessGet full text
ISSN0253-3766
DOI10.3760/cma.j.cn112152-20231024-00214

Cover

More Information
Summary:目的:探讨脂肪非典型钙黏蛋白1（FAT1）基因在胰腺癌中的表达情况及其与胰腺癌的临床病理特征、预后及免疫治疗的关系。方法:（1）生物信息学分析：基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库中179例胰腺癌的FAT1 mRNA表达和临床数据、基因型-组织表达（GTEx）数据库中328例正常胰腺组织的FAT1 mRNA表达数据，分析胰腺癌和正常胰腺组织中FAT1 mRNA的表达差异及FAT1 mRNA表达与胰腺癌分化程度、临床分期、预后、免疫细胞浸润、免疫检查点关联基因的关系，应用Limma 3.40.2软件包分析FAT1相关差异表达基因，并对差异表达基因进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过人类蛋白质图谱（HPA）数据库分析FAT1在胰腺癌及癌旁组织中免疫组织化学（IHC）染色情况。（2）自有组织样本验证：收集2010年3月8日至2020年9月30日浙江省肿瘤医院收治的192例胰腺导管腺癌患者的组织样本和临床、预后资料，对组织样本进行IHC染色，验证FAT1在胰腺癌中的蛋白表达及其与免疫相关蛋白、胰腺癌分化程度、临床分期、预后的关系。结果:（1）生物信息学分析：来自TCGA数据库的179例胰腺癌组织FAT1 mRNA表达量为5.55±1.04，高于来自GTEx数据库的328例正常胰腺组织FAT1 mRNA的表达量（2.95±0.53， P＜0.001）。FAT1特异性IHC染色图像显示，胰腺癌组织FAT1表达普遍较高，且FAT1的表达从细胞膜向细胞质转移。高分化组（31例）、中分化组（96例）和低分化组（52例）FAT1 mRNA表达量分别为4.99±1.46、5.51±0.80和5.68±1.08，均高于正常胰腺组织（均 P＜0.001），中分化组、低分化组FAT1 mRNA表达量均高于高分化组（均 P＜0.001）。90例FAT1 mRNA低表达组患者的中位无进展生存时间（PFS）和中位总生存时间（OS）分别为16.5和24个月，均长于89例FAT1 mRNA高表达组（中位PFS和OS分别为13和18个月， P值分别为0.011和0.005）。多因素Cox回归分析显示，FAT1 mRNA表达水平为胰腺癌患者OS的独立影响因素（ HR=1.47，95% CI：1.09～1.99）。相关分析显示，胰腺癌中FAT1 mRNA的表达量与B细胞浸润、CD8 + T细胞浸润、中性粒细胞浸润、巨噬
ISSN:0253-3766
DOI:10.3760/cma.j.cn112152-20231024-00214