基于RBL-2H3模型分析过敏反应效应细胞激活的差异基因

TS201.6; 构建IgE介导的大鼠嗜碱性粒细胞(rat basophilic leukemia,RBL)-2H3作为过敏反应细胞模型,并利用转录组测序分析比较RBL-2H3细胞激活前后的转录组基因差异,富集相关信号通路.IgE介导的RBL-2H3细胞激活后,过敏介质和细胞因子分泌显著提高;转录组测序得到RBL-2H3细胞激活前后的232个差异表达基因,其中有127个(54.74％)可进行基因功能注释;RBL-2H3细胞激活主要影响肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶、Janus激酶-信号转导与转录激活子、Toll样受体等信号通路,涉及的转录因子有MAP3K8、Nfkbia、Junb、Jun、F...

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Published in食品科学 Vol. 43; no. 22; pp. 105 - 112
Main Authors 刘艳, 谷福蝶, 陈慧莹, 李焱, 周钰, 张军, 刘红, 曹敏杰, 刘光明, 刘庆梅
Format Magazine Article
LanguageChinese
Published 集美大学海洋食品与生物工程学院,福建省海洋功能食品工程技术研究中心,福建厦门 361021 25.11.2022
Subjects
差异表达基因
过敏反应
转录组测序
信号通路
大鼠嗜碱性粒细胞
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ISSN1002-6630
DOI10.7506/spkx1002-6630-20211223-265

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Summary:TS201.6; 构建IgE介导的大鼠嗜碱性粒细胞(rat basophilic leukemia,RBL)-2H3作为过敏反应细胞模型,并利用转录组测序分析比较RBL-2H3细胞激活前后的转录组基因差异,富集相关信号通路.IgE介导的RBL-2H3细胞激活后,过敏介质和细胞因子分泌显著提高;转录组测序得到RBL-2H3细胞激活前后的232个差异表达基因,其中有127个(54.74％)可进行基因功能注释;RBL-2H3细胞激活主要影响肿瘤坏死因子、丝裂原活化蛋白激酶、Janus激酶-信号转导与转录激活子、Toll样受体等信号通路,涉及的转录因子有MAP3K8、Nfkbia、Junb、Jun、Fos等.本研究建立了IgE介导的过敏反应体外细胞模型,并且通过对效应细胞转录组信息的全面分析和潜在靶点及信号通路的富集为过敏性疾病的防控治疗提供参考.
ISSN:1002-6630
DOI:10.7506/spkx1002-6630-20211223-265