虾夷扇贝AMPK基因家族的鉴定及表达

Q786%S917.4; 为了解AMPK基因家族在虾夷扇贝中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组学及生物信息学的方法对虾夷扇贝AMPK基因家族进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析以及时空表达分析,通过虾夷扇贝亚致死温度胁迫实验,研究了AMPK基因家族在高温胁迫时的表达规律.结果显示,虾夷扇贝基因组中共存在3个AMPK家族基因,即PyAMPKα、PyAMPKβ、PyAMPKγ.时空表达分析发现,PyAMPK的3个家族基因在D型幼虫期之前均呈现较高的表达量,其中PyAMPKa基因在受精卵时期表达量最高,PyAMPKβ基因在囊胚时期表达量最高,PyAMPKγ基因在受精卵和2～8细胞时...

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Published in水产学报 Vol. 48; no. 10; pp. 28 - 39
Main Authors 吕珍立, 黄晓文, 孙凤芝, 邢强, 王静, 刘平平, 安行健, 吕佳
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 中国海洋大学,方宗熙海洋生物进化与发育研究中心,山东青岛 266003 2024
青岛海洋科学与技术国家试点实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东青岛 266237%中国海洋大学,海洋生物遗传与育种教育部重点实验室,山东青岛 266003
中国海洋大学,海洋生物遗传与育种教育部重点实验室,山东青岛 266003%中国海洋大学,海洋生物遗传与育种教育部重点实验室,山东青岛 266003
青岛海洋科学与技术国家试点实验室,海洋生物学与生物技术功能实验室,山东青岛 266237%中国海洋大学,海洋生命科学实验教学中心,山东青岛 266003
Subjects
虾夷扇贝
heat stress
expression analysis
AMPK基因家族
Patinopecten yessoensis
表达分析
gene identification
基因鉴定
高温胁迫
AMPK gene family
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ISSN1000-0615
DOI10.11964/jfc.20220913709

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Summary:Q786%S917.4; 为了解AMPK基因家族在虾夷扇贝中的特征、进化及生物学功能,实验采用比较基因组学及生物信息学的方法对虾夷扇贝AMPK基因家族进行了鉴定、基因与蛋白结构分析、系统发生分析以及时空表达分析,通过虾夷扇贝亚致死温度胁迫实验,研究了AMPK基因家族在高温胁迫时的表达规律.结果显示,虾夷扇贝基因组中共存在3个AMPK家族基因,即PyAMPKα、PyAMPKβ、PyAMPKγ.时空表达分析发现,PyAMPK的3个家族基因在D型幼虫期之前均呈现较高的表达量,其中PyAMPKa基因在受精卵时期表达量最高,PyAMPKβ基因在囊胚时期表达量最高,PyAMPKγ基因在受精卵和2～8细胞时期的表达量达到最高水平.PyAMPK在虾夷扇贝成体器官中呈现不同的表达模式,其中肾脏表达量最高,其次是鳃.受高温胁迫后,肾脏和鳃中的PyAMPK基因短时间内呈现显著的上调表达,并随着时间延长呈现先上升后下降的趋势.研究表明,AMPK基因家族参与了虾夷扇贝早期胚胎发育过程的能量代谢调节以及机体面对高温胁迫的应激调节过程.本研究有助于理解贝类AMPK基因的功能和进化,并为深入阐明贝类应对高温胁迫时的能量调节机制提供理论基础.
ISSN:1000-0615
DOI:10.11964/jfc.20220913709