梨花粉自交不亲和基因克隆及其评价分析
S661.2; [目的]获得梨SFBB新基因全长序列,研究不同SFBB基因参与梨自交不亲和的作用.[方法]设计特异性引物扩增梨SFBB22-gamma基因组DNA全长序列,并对所有己鉴定、能够与梨S-RNase基因一一对应的SFBB基因全长序列进行比较分析.[结果]梨SFBB22-gamma基因编码区序列大小为1191 bp,编码396个氨基酸,ProtParam预测分子质量为45.47 ku,理论等电点4.67,为酸性亲水不稳定蛋白.其中N端包含由50个氨基酸组成的F-box序列,蛋白质二级结构有5个α-螺旋和24个β-折叠.不同梨SFBB基因和对应S-RNase基因在序列变异、基因多态性以...
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| Published in | 果树学报 Vol. 39; no. 6; pp. 905 - 919 |
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| Main Authors | , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Chinese |
| Published |
温州科技职业学院,浙江温州325006%中国林业科学研究院经济林研究所,郑州450003
10.06.2022
中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004%中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 1009-9980 |
| DOI | 10.13925/j.cnki.gsxb.20220080 |
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| Abstract | S661.2; [目的]获得梨SFBB新基因全长序列,研究不同SFBB基因参与梨自交不亲和的作用.[方法]设计特异性引物扩增梨SFBB22-gamma基因组DNA全长序列,并对所有己鉴定、能够与梨S-RNase基因一一对应的SFBB基因全长序列进行比较分析.[结果]梨SFBB22-gamma基因编码区序列大小为1191 bp,编码396个氨基酸,ProtParam预测分子质量为45.47 ku,理论等电点4.67,为酸性亲水不稳定蛋白.其中N端包含由50个氨基酸组成的F-box序列,蛋白质二级结构有5个α-螺旋和24个β-折叠.不同梨SFBB基因和对应S-RNase基因在序列变异、基因多态性以及进化特性等方面存在差异.[结论]现有序列数据显示,梨SFBB基因的序列多态性和变异位点均小于S-RNase.梨SFBB基因4个群体中单个群体SFBB-beta基因和对应S-RNase基因在序列特征上最接近;4个梨SFBB基因个体作为整体与对应S-RNase基因序列特征比SFBB-beta基因和对应S-RNase基因序列特征更接近.SFBB-beta基因存在独自参与自交不亲和的可能性,SFBB-alpha以及SFBB-gamma基因不存在独自参与自交不亲和的可能性. |
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| AbstractList | S661.2; [目的]获得梨SFBB新基因全长序列,研究不同SFBB基因参与梨自交不亲和的作用.[方法]设计特异性引物扩增梨SFBB22-gamma基因组DNA全长序列,并对所有己鉴定、能够与梨S-RNase基因一一对应的SFBB基因全长序列进行比较分析.[结果]梨SFBB22-gamma基因编码区序列大小为1191 bp,编码396个氨基酸,ProtParam预测分子质量为45.47 ku,理论等电点4.67,为酸性亲水不稳定蛋白.其中N端包含由50个氨基酸组成的F-box序列,蛋白质二级结构有5个α-螺旋和24个β-折叠.不同梨SFBB基因和对应S-RNase基因在序列变异、基因多态性以及进化特性等方面存在差异.[结论]现有序列数据显示,梨SFBB基因的序列多态性和变异位点均小于S-RNase.梨SFBB基因4个群体中单个群体SFBB-beta基因和对应S-RNase基因在序列特征上最接近;4个梨SFBB基因个体作为整体与对应S-RNase基因序列特征比SFBB-beta基因和对应S-RNase基因序列特征更接近.SFBB-beta基因存在独自参与自交不亲和的可能性,SFBB-alpha以及SFBB-gamma基因不存在独自参与自交不亲和的可能性. |
| Author | 乌云塔娜 梁文杰 谭晓风 |
| AuthorAffiliation | 温州科技职业学院,浙江温州325006%中国林业科学研究院经济林研究所,郑州450003;中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004%中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004 |
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| Author_FL | WUYUN Tana TAN Xiaofeng LIANG Wenjie |
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| DOI | 10.13925/j.cnki.gsxb.20220080 |
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| DocumentTitle_FL | Cloning and evaluation of S locus F-box brother genes in genus Pyrus plants |
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| Issue | 6 |
| Keywords | 梨 自交不亲和性 共同进化 SFBB基因 |
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| PublicationDecade | 2020 |
| PublicationTitle | 果树学报 |
| PublicationTitle_FL | Journal of Fruit Science |
| PublicationYear | 2022 |
| Publisher | 温州科技职业学院,浙江温州325006%中国林业科学研究院经济林研究所,郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004%中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004 |
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