梨花粉自交不亲和基因克隆及其评价分析

S661.2; [目的]获得梨SFBB新基因全长序列,研究不同SFBB基因参与梨自交不亲和的作用.[方法]设计特异性引物扩增梨SFBB22-gamma基因组DNA全长序列,并对所有己鉴定、能够与梨S-RNase基因一一对应的SFBB基因全长序列进行比较分析.[结果]梨SFBB22-gamma基因编码区序列大小为1191 bp,编码396个氨基酸,ProtParam预测分子质量为45.47 ku,理论等电点4.67,为酸性亲水不稳定蛋白.其中N端包含由50个氨基酸组成的F-box序列,蛋白质二级结构有5个α-螺旋和24个β-折叠.不同梨SFBB基因和对应S-RNase基因在序列变异、基因多态性以...

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Published in果树学报 Vol. 39; no. 6; pp. 905 - 919
Main Authors 梁文杰, 乌云塔娜, 谭晓风
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 温州科技职业学院,浙江温州325006%中国林业科学研究院经济林研究所,郑州450003 10.06.2022
中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004%中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业和草原局重点实验室,长沙410004
Subjects
梨
自交不亲和性
共同进化
SFBB基因
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ISSN1009-9980
DOI10.13925/j.cnki.gsxb.20220080

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Summary:S661.2; [目的]获得梨SFBB新基因全长序列,研究不同SFBB基因参与梨自交不亲和的作用.[方法]设计特异性引物扩增梨SFBB22-gamma基因组DNA全长序列,并对所有己鉴定、能够与梨S-RNase基因一一对应的SFBB基因全长序列进行比较分析.[结果]梨SFBB22-gamma基因编码区序列大小为1191 bp,编码396个氨基酸,ProtParam预测分子质量为45.47 ku,理论等电点4.67,为酸性亲水不稳定蛋白.其中N端包含由50个氨基酸组成的F-box序列,蛋白质二级结构有5个α-螺旋和24个β-折叠.不同梨SFBB基因和对应S-RNase基因在序列变异、基因多态性以及进化特性等方面存在差异.[结论]现有序列数据显示,梨SFBB基因的序列多态性和变异位点均小于S-RNase.梨SFBB基因4个群体中单个群体SFBB-beta基因和对应S-RNase基因在序列特征上最接近;4个梨SFBB基因个体作为整体与对应S-RNase基因序列特征比SFBB-beta基因和对应S-RNase基因序列特征更接近.SFBB-beta基因存在独自参与自交不亲和的可能性,SFBB-alpha以及SFBB-gamma基因不存在独自参与自交不亲和的可能性.
ISSN:1009-9980
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20220080