식품에서 분리된 살모넬라(Salmonella enterica Enteritidis MFDS1022168)의 유전체 서열 분석

• Published in: Han'gug sigpum wi'saeng anjeonseong haghoeji Vol. 39; no. 6; pp. 616 - 619
• Main Authors: 김예은, 이우정, 안은숙, 김승환, 주인선, Yeeun Kim, Woojung Lee, Eun Sook An, Seung Hwan Kim, Insun Joo
• Format: Journal Article
• Language: Korean
• Published: 한국식품위생안전성학회 01.12.2024
• Subjects: 식품과학; enterica serovar Enteritidis; Complete genome; Gimbap; Salmonella enterica subsp
• ISSN: 1229-1153; 2465-9223

Salmonella enterica is an infectious foodborne pathogen causing major public health problems worldwide. We present here the complete genome sequence of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Enteritidis isolate MFDS1022168, that was isolated from a gimbap in Gyeonggi-do, South Korea, in 2022. The complete genome sequence of MFDS1022168 consists of a circular chromosome of 4,771,958 bp with a G + C content of 52.0%, and a plasmid of 59,372 bp with a G + C content of 51.9%. The chromosome is characterized by the presence of Salmonella pathogenicity islands containing virulence factor-encoding genes such as invA. Gene prediction analysis showed that the chromosome possesses 4,776 coding sequence (CDS) as well as 84 tRNA and 22 rRNA genes. Salmonella enterica는 세계적으로 가장 널리 알려진 식중독균이다. Salmonella enterica Enteritidis MFDS1022168은 인천보건환경연구원에서 계란에서 분리된 균주로, 이 균주가 지니고 있는 병원성에 대한 genome 수준의 메커니즘을 이해하기 위하여 whole genome sequencing을 진행하여 유전체를 분석하였다. PacBio Sequel 장비를 이용하여 유전체염기서열 분석을 진행한 결과 invA를 비롯한 여러 종류의 병원성유전자를 갖고 있는 것으로 확인됐다. 이에 따라 해당 균주의 독성을 파악하기 위해 유전체분석을 진행하였다. 유전자 총 수 예측 결과, 4,776개의 CDSs, 84개의 tRNA, 22개의 rRNA를 보유한 것으로 나타났다.