Trends and outlook of single-cell analysis

• Published in: JSBi Bioinformatics Review Vol. 3; no. 2; pp. 61 - 74
• Main Author: Nakajima, Natsu
• Format: Journal Article
• Language: Japanese
• Published: Japanese Society for Bioinformatics 2022; 特定非営利活動法人 日本バイオインフォマティクス学会
• ISSN: 2435-7022
• DOI: 10.11234/jsbibr.2022.4

生体組織のゲノム情報を個々の細胞レベルで網羅的に計測し解析するシングルセル解析が可能となり、組織を構成する各細胞の挙動や多様な細胞種の性質について分析することができる。シングルセル解析においては、各細胞での遺伝子発現量（Single-cell RNA sequencing）と数理的手法とに基づいて、細胞種分類や軌道推定、遺伝子間相互作用推定などが行われている。本稿では、scRNA-seqデータに関する基礎知識や、シングルセル解析の動向と注目のトピックスに関して、各解析の概要と適用される数理的手法について概説する。