新規な遺伝子検査プロトコール開発とアルコール代謝関連遺伝子多型への応用
「緒言」PCRを応用したsingle nucleotide polymorphism(SNP)タイピング法としてallele specific primer-PCR(ASP-PCR), PCR-restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLP), TaqMan PCR法などがある. これらの操作においてはサンプル中のPCR阻害物質を除去するためDNA抽出・精製のステップが不可欠である. しかし, このDNA抽出・精製ステップは高回収率のもと迅速性, 簡便性, 廉価が求められる臨床応用研究においては, 操作上の大きな障害となっている. われわ...
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| Published in | YAKUGAKU ZASSHI Vol. 139; no. 8; pp. 1111 - 1119 |
|---|---|
| Main Authors | , , , , , , , |
| Format | Journal Article |
| Language | Japanese |
| Published |
公益社団法人 日本薬学会
01.08.2019
日本薬学会 |
| Subjects | |
| Online Access | Get full text |
| ISSN | 0031-6903 1347-5231 |
| DOI | 10.1248/yakushi.19-00016 |
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| Abstract | 「緒言」PCRを応用したsingle nucleotide polymorphism(SNP)タイピング法としてallele specific primer-PCR(ASP-PCR), PCR-restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLP), TaqMan PCR法などがある. これらの操作においてはサンプル中のPCR阻害物質を除去するためDNA抽出・精製のステップが不可欠である. しかし, このDNA抽出・精製ステップは高回収率のもと迅速性, 簡便性, 廉価が求められる臨床応用研究においては, 操作上の大きな障害となっている. われわれは, TaqMan PCR法を例に, 血液・唾液などの液状の生体サンプルから従来のゲノムDNA抽出・精製を行わずSNPタイピングを行う新規な遺伝子検査プロトコールについて検討を行ってきた. これまでに得られた成果は次の3点に要約される. |
|---|---|
| AbstractList | 「緒言」PCRを応用したsingle nucleotide polymorphism(SNP)タイピング法としてallele specific primer-PCR(ASP-PCR), PCR-restriction fragment length polymorphisms (PCR-RFLP), TaqMan PCR法などがある. これらの操作においてはサンプル中のPCR阻害物質を除去するためDNA抽出・精製のステップが不可欠である. しかし, このDNA抽出・精製ステップは高回収率のもと迅速性, 簡便性, 廉価が求められる臨床応用研究においては, 操作上の大きな障害となっている. われわれは, TaqMan PCR法を例に, 血液・唾液などの液状の生体サンプルから従来のゲノムDNA抽出・精製を行わずSNPタイピングを行う新規な遺伝子検査プロトコールについて検討を行ってきた. これまでに得られた成果は次の3点に要約される. |
| Author | 市川, 厚 坂口, 友唯 河井, 沙由梨 村田, 成範 木下, 健司 今井, 美穂 競, 和佳 山村, 美和子 |
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| Copyright | 2019 The Pharmaceutical Society of Japan |
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| Discipline | Pharmacy, Therapeutics, & Pharmacology |
| EISSN | 1347-5231 |
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| Issue | 8 |
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| PublicationDecade | 2010 |
| PublicationTitle | YAKUGAKU ZASSHI |
| PublicationTitleAlternate | 薬学雑誌 |
| PublicationYear | 2019 |
| Publisher | 公益社団法人 日本薬学会 日本薬学会 |
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| References | 12) Relling M. V., Evans W. E., Nature, 526, 343-350 (2015). 5) Ota T., Kamada Y., Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Int. J. Med. Sci., 12, 78-82 (2015). 15) Hosono N., Kato M., Kiyotani K., Mushiroda T., Takata S., Sato H., Amitani H., Tsuchiya Y., Yamazaki K., Tsunoda T., Zembutsu H., Nakamura Y., Kubo M., Clin. Chem., 55, 1546-1554 (2009). 2) Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Yokoyama A., Kinoshita K., Anal. Sci., 26, 503-505 (2010). 10) Naruoka H., Ogino A., Matsumori Y., Japan Tappi Journal, 65, 360-363 (2011). 9) Hayashida M., Kamada Y., Ota T., Kojima S., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Nippon Eiseigaku Zasshi, 70, 134-138 (2015). 1) Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Anal. Sci., 25, 1487-1489 (2009). 6) Ota T., Hayashida M., Ishii M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Drug Metab. Pharmacokinet., 29, 283-285 (2014). 11) URI Genomics & Sequencing Center. Calculator for determining the number of copies of a template: 〈https://cels.uri.edu/gsc/cndna.html〉, cited 1 February, 2018. 3) Ota T., Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Jpn. J. Pharm. Health Care Sci., 40, 402-408 (2014). 8) Hayashida M., Kinoshita K., J. Brew. Soc. Jpn., 109, 2-10 (2014). 13) Mizuno Y., Harada E., Morita S., Kinoshita K., Hayashida M., Shono M., Morikawa Y., Murohara T., Nakayama M., Yoshimura M., Yasue H., Circulation, 131, 1665-1673 (2015). 4) Hayashida M., Ota T., Ishii M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Anal. Sci., 30, 427-429 (2014). 7) Murata S., Hayashida M., Ishiguro-Tanaka Y., Imazeki H., Hayashi E., Yokoyama A., Kinoshita K., The Official Journal of Japanese Society of Laboratory Medicine, 63, 1253-1258 (2015). 14) Ramamoorthy A., Flockhart D. A., Hosono N., Kubo M., Nakamura Y., Skaar T. C., Pharmacogenet. Genomics, 20, 451-454 (2010). |
| References_xml | – reference: 3) Ota T., Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Jpn. J. Pharm. Health Care Sci., 40, 402-408 (2014). – reference: 11) URI Genomics & Sequencing Center. Calculator for determining the number of copies of a template: 〈https://cels.uri.edu/gsc/cndna.html〉, cited 1 February, 2018. – reference: 13) Mizuno Y., Harada E., Morita S., Kinoshita K., Hayashida M., Shono M., Morikawa Y., Murohara T., Nakayama M., Yoshimura M., Yasue H., Circulation, 131, 1665-1673 (2015). – reference: 7) Murata S., Hayashida M., Ishiguro-Tanaka Y., Imazeki H., Hayashi E., Yokoyama A., Kinoshita K., The Official Journal of Japanese Society of Laboratory Medicine, 63, 1253-1258 (2015). – reference: 15) Hosono N., Kato M., Kiyotani K., Mushiroda T., Takata S., Sato H., Amitani H., Tsuchiya Y., Yamazaki K., Tsunoda T., Zembutsu H., Nakamura Y., Kubo M., Clin. Chem., 55, 1546-1554 (2009). – reference: 8) Hayashida M., Kinoshita K., J. Brew. Soc. Jpn., 109, 2-10 (2014). – reference: 2) Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Yokoyama A., Kinoshita K., Anal. Sci., 26, 503-505 (2010). – reference: 1) Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Anal. Sci., 25, 1487-1489 (2009). – reference: 4) Hayashida M., Ota T., Ishii M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Anal. Sci., 30, 427-429 (2014). – reference: 6) Ota T., Hayashida M., Ishii M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Drug Metab. Pharmacokinet., 29, 283-285 (2014). – reference: 10) Naruoka H., Ogino A., Matsumori Y., Japan Tappi Journal, 65, 360-363 (2011). – reference: 5) Ota T., Kamada Y., Hayashida M., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Int. J. Med. Sci., 12, 78-82 (2015). – reference: 12) Relling M. V., Evans W. E., Nature, 526, 343-350 (2015). – reference: 9) Hayashida M., Kamada Y., Ota T., Kojima S., Iwao-Koizumi K., Murata S., Kinoshita K., Nippon Eiseigaku Zasshi, 70, 134-138 (2015). – reference: 14) Ramamoorthy A., Flockhart D. A., Hosono N., Kubo M., Nakamura Y., Skaar T. C., Pharmacogenet. Genomics, 20, 451-454 (2010). |
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| SourceID | medicalonline jstage |
| SourceType | Publisher |
| StartPage | 1111 |
| SubjectTerms | ADH1B and ALDH2 dried saliva genotyping single nucleotide polymorphism TaqMan PCR water-soluble paper |
| Title | 新規な遺伝子検査プロトコール開発とアルコール代謝関連遺伝子多型への応用 |
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