半導体マイクロチップ対応次世代シーケンサーを用いたがん関連遺伝子の解析

• Published in: 山口医学 Vol. 63; no. 4; pp. 253 - 256
• Main Authors: 水上, 洋一, 井上, 雄太郎, 狩生, 徹
• Format: Journal Article
• Language: Japanese
• Published: 山口大学医学会 01.11.2014
• Subjects: がん遺伝子; 体細胞変異; 次世代シーケンサー
• ISSN: 0513-1731; 1880-4462
• DOI: 10.2342/ymj.63.253

「和文抄録」 半導体マイクロチップ技術を利用した次世代DNAシーケンサーは, 比較的長いリード長や迅速な解析等の利点から急速に普及しつつある. また, がんなどの疾患を標的としたアンプリコンライブラリー作製技術も進展し, 両者を組み合わせた大規模変異遺伝子解析がより身近なものになった. 現在我々の研究室で行っている解析を例に, 臨床サンプルを用いたがん関連遺伝子体細胞変異同定法について紹介する. 「はじめに」 近年の大規模遺伝子解析技術の進展は目覚ましく, ベンチトップの機器を用いたギガベース規模のゲノム解析も可能となり, 小規模の研究グループでも利用可能になってきた. Life Technologies社製Ion PGMシーケンサーは半導体マイクロチップを利用してDNA伸長時に放出されるプロトンを検出する世界初の次世代シーケンサーである. 塩基の蛍光標識や光学的検出方法が不要で迅速な解析(1週間以内で解析終了)が可能である.