次世代シーケンサーデータの解析手法 第 10 回 DDBJ への塩基配列の登録（実践編）

多くの学術雑誌は、その論文中で決定された塩基配列を国際塩基配列データベース（International Nucleotide Sequence Database Collaboration; INSDC）に登録することを掲載の条件としている。DNA Data Bank of Japan（DDBJ）は、INSDC を構成する日米欧三極の1 つである。本稿では、DDBJ への登録用アカウントの取得から、Lactobacillus acidipiscis JCM 10692T 株のゲノム配列登録作業について解説する。ウェブサイト（R で）塩基配列解析（URL: http://www.iu.a.u-t...

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Bibliographic Details
Published in日本乳酸菌学会誌 Vol. 28; no. 2; pp. 94 - 100
Main Authors 坂本, 光央, 門田, 幸二, 中村, 保一, 谷澤, 靖洋, 真島, 淳, 李, 慶範, 清水, 謙多郎, 藤澤, 貴智, 遠野, 雅徳, 大熊, 盛也
Format Journal Article
LanguageJapanese
Published 日本乳酸菌学会 26.06.2017
Subjects
D-way
DDBJ
INSDC
JCM
MSS
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ISSN1343-327X
2186-5833
DOI10.4109/jslab.28.94

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Summary:多くの学術雑誌は、その論文中で決定された塩基配列を国際塩基配列データベース（International Nucleotide Sequence Database Collaboration; INSDC）に登録することを掲載の条件としている。DNA Data Bank of Japan（DDBJ）は、INSDC を構成する日米欧三極の1 つである。本稿では、DDBJ への登録用アカウントの取得から、Lactobacillus acidipiscis JCM 10692T 株のゲノム配列登録作業について解説する。ウェブサイト（R で）塩基配列解析（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html）中に本連載をまとめた項目（URL: http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r_seq.html#about_book_JSLAB）が存在する。ウェブ資料（以下、W）や関連ウェブサイトなどを効率的に活用してほしい。
ISSN:1343-327X
2186-5833
DOI:10.4109/jslab.28.94