梅花鹿DLX5基因克隆及表达分析

• Published in: 野生动物学报 Vol. 45; no. 1; pp. 50 - 57
• Main Authors: 王鹏, 刘方政, 李萱博, 王春花, 于海浩, 夏彦玲
• Format: Journal Article
• Language: Chinese
• Published: 东北林业大学野生动物与自然保护地学院,哈尔滨,150040%黑龙江工程学院计算机科学与技术学院,哈尔滨,150050 01.02.2024; Editorial Department of Chinese Journal of Wildlife
• Subjects: DLX5基因; 基因克隆; 实时荧光定量RT-PCR; 梅花鹿; 生物信息学分析; Bioinformatics analysis; Real-time RT-PCR; Sika deer(Cervus nippon); DLX5基因; Gene cloning; 梅花鹿; 生物信息学分析; 实时荧光定量RT-PCR; 基因克隆; DLX5 gene
• ISSN: 2310-1490
• DOI: 10.12375/ysdwxb.20240107

Q785; 为研究梅花鹿(Cervus nippon)DLX5基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿DLX5基因进行克隆,获得包含全部编码区的cDNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过KEGG富集分析其信号通路,运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况.结果表明:梅花鹿DLX5基因编码区长为870 bp,共编码289个氨基酸.DLX5蛋白为可溶性的不稳定蛋白,有2个保守结构域,主要定位于细胞核.梅花鹿DLX5蛋白与许多不同物种来源的DLX5蛋白氨基酸序列有较高相似度,比较保守.DLX5蛋白二级结构中无规则卷曲占比最大(78.89%),其后依次是α-螺旋、延伸链,占比分别为16.96%和4.15%.DLX5基因主要的作用通路为TGFβ信号通路、MAPK信号通路和Wnt信号通路等.实时荧光定量RT-PCR结果表明,DLX5基因在鹿茸生长后期(三杈茸)表达量显著增高,这种上调表达暗示了其在鹿茸骨化过程中发挥重要作用,说明其可能是鹿茸骨化相关候选基因.