光学基因组图谱技术在复杂染色体重排中的应用

R394.3; [目的]探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用.[方法]收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比.[结果]相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符.OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符.OGM无法检测到罗氏易位.[结论]OGM因其超长读...

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Published inZhongshan da xue xue bao. Zhongshan daxue xuebao yixue kexue ban = Journal of Sun Yat-sen University. Yi xue ke xue ban Vol. 44; no. 6; pp. 943 - 948
Main Authors 何姝婧, 张志强, 黄乙涓, 徐丽南, 陈元球, 方丛, 任姿
Format Journal Article
LanguageChinese
Published 广州市黄埔区中六生物医学创新研究院,广东 广州 510655%广东省生育力保存工程技术研究中心,广东 广州 510655 01.11.2023
中山大学附属第六医院妇产科,广东 广州 510655
中山大学附属第六医院生殖中心,广东 广州 510655
广东省生育力保存工程技术研究中心,广东 广州 510655
Editorial Office of Journal of Sun Yat-sen University
Subjects
光学基因组图谱技术
复杂染色体重排
纳米孔测序
胚胎植入前遗传学检测
辅助生殖
nanopore sequencing
optical genome mapping
complex chromosomal rearrangement
assisted reproduction
光学基因组图谱技术
复杂染色体重排
胚胎植入前遗传学检测
辅助生殖
纳米孔测序
pre-implanta-tion genetic testing
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ISSN1672-3554
DOI10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0

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Summary:R394.3; [目的]探讨光学基因组图谱技术(OGM)在复杂染色体重排中的应用.[方法]收集2022年1月到2023年6月期间,在中山大学附属第六医院生殖医学中心进行辅助生殖助孕的染色体复杂重排患者5例,对患者进行OGM检测,纳米孔三代测序和胚胎植入前遗传学检测(PGT),并与核型分析、染色体微阵列分析技术(CMA)/基因组拷贝数变异测序(CNV-Seq)的结果分析对比.[结果]相互易位合并插入,相互易位合并倒位,三联易位均能被OGM成功检测,且与纳米孔测序和CMA/CNV-Seq结果相符.OGM成功定位断裂点位置,并与胚胎检测结果验证相符.OGM无法检测到罗氏易位.[结论]OGM因其超长读长,实现了跨越重复区域的检测能力,能够准确定位结构重排,可以有效地辅助复杂染色体重排的临床诊断.
ISSN:1672-3554
DOI:10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2023.0