沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的二级结构及B、T细胞表位分析

目的 分析沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的二级结构及B、T细胞表位。方法 采用计算机在线预测网站PSIPRED V3.3对沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原蛋白的二级结构进行预测和分析;采用BCEpred和ABCpred网络软件对沙眼衣原体主要外膜蛋白B细胞表位进行预测和分析;采用SYFPEITHI在线软件对沙眼衣原体主要外膜蛋白的MHC-Ⅰ类HLA-A 0201限制性T细胞表位进行预测和分析。结果 沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原蛋白的二级结构中无规则卷曲结构占32.49%、α螺旋结构占41.62%、β-折叠结构占19.80%。沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的B细胞表位氨基酸序列位点分别为41~50、92~101...

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Published in山东医药 Vol. 56; no. 23; pp. 20 - 22
Main Author 阿曼古丽·牙生 兰希 伊慧霞 古丽扎尔·阿不都纳斯尔 彭珊珊 冯宁 闫怡 李慧君 马秀敏
Format Magazine Article
LanguageChinese
Published 新疆医科大学基础医学院 2016
新疆医科大学第一附属医院,新疆重大疾病医学重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,乌鲁木齐830011%新疆医科大学基础医学院%新疆医科大学第一附属医院,新疆重大疾病医学重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地,乌鲁木齐830011
Subjects
B细胞表位
T细胞表位
抗原表位
沙眼衣原体主要外膜蛋白
Chlamydia trachomatis,major outer membrane protein
T细胞表位
抗原表位
T-cell epitope
B细胞表位
沙眼衣原体主要外膜蛋白
antigenic epitope
B-cell epitope
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ISSN1002-266X
DOI10.3969/j.issn.1002-266X.2016.23.006

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Summary:目的 分析沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的二级结构及B、T细胞表位。方法 采用计算机在线预测网站PSIPRED V3.3对沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原蛋白的二级结构进行预测和分析;采用BCEpred和ABCpred网络软件对沙眼衣原体主要外膜蛋白B细胞表位进行预测和分析;采用SYFPEITHI在线软件对沙眼衣原体主要外膜蛋白的MHC-Ⅰ类HLA-A 0201限制性T细胞表位进行预测和分析。结果 沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原蛋白的二级结构中无规则卷曲结构占32.49%、α螺旋结构占41.62%、β-折叠结构占19.80%。沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的B细胞表位氨基酸序列位点分别为41~50、92~101、51~60、306~315、260~269和160~169,MHC-Ⅰ类HLA-A 0201限制性T细胞表位氨基酸序列位点分别为201~209、379~387、3~11、126~134和177~185。结论沙眼衣原体主要外膜蛋白抗原的二级结构中无规则卷曲结构、α螺旋结构所占比例高,有6个B细胞表位和5个T细胞表位。
Bibliography:37-1156/R
Objective To analyze the secondary structure and B, T-cell epitope analysis of major outer membrane protein of Chlamydia trachomatis （ Ct MOMP）. Methods This study was based on the prediction and analysis of the secondary structure using PSIPRED V3.3 and B cell epitopes using BCEpred and ABCPred software and T cell epitopes using SYFPEITHI software for the Ct MOMP antigen protein. Results In the secondary structure of Ct MOMP, random coil accounted for 32.49% , oL-helix structure accounted for 41.62% , β-folding structure accounted for 19.80%. The amino acid sequences of Ct MOMP B-cell epitopes were the 41-50, 92-101, 51-60, 306-315, 260-269 and 160-169. The amino acid sequences of restrictive T-cell epitopes in MHC-I type of HLA-A 0201 were 201-209, 379-387, 3-11, 126-134 and 177- 185. Conclusion There is no random coil in the secondary structure of Ct MOMP, the proportion of or-helix structure is high in secondary structure of Ct MOMP, and there are 6 B-cell epitopes and 5 T-cell epitopes.
Chlamydia
ISSN:1002-266X
DOI:10.3969/j.issn.1002-266X.2016.23.006